Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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CASQ1P31415 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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CASQ1P31415 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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CASQ1P31415 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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CASQ1P31415 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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CASQ1P31415 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
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CASQ1P31415 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
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CASQ1P31415 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
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CASQ1P31415 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CASQ1P31415 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CASQ1P31415 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CASQ1P31415 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CASQ1P31415 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
CASQ1P31415 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASQ1P31415 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASQ1P31415 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
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CASQ1P31415 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASQ1P31415 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASQ1P31415 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASQ1P31415 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASQ1P31415 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASQ1P31415 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
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