Protein–RNA interactions for Protein: P29376

LTK, Leukocyte tyrosine kinase receptor, humanhuman

Predictions only

Length 864 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTKP29376 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LTKP29376 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LTKP29376 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LTKP29376 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LTKP29376 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LTKP29376 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LTKP29376 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LTKP29376 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LTKP29376 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
LTKP29376 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LTKP29376 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LTKP29376 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LTKP29376 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
LTKP29376 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
LTKP29376 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LTKP29376 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LTKP29376 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
LTKP29376 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LTKP29376 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
LTKP29376 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LTKP29376 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LTKP29376 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
LTKP29376 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LTKP29376 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LTKP29376 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LTKP29376 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LTKP29376 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LTKP29376 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LTKP29376 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LTKP29376 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LTKP29376 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LTKP29376 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LTKP29376 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LTKP29376 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LTKP29376 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LTKP29376 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LTKP29376 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LTKP29376 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LTKP29376 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LTKP29376 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LTKP29376 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LTKP29376 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LTKP29376 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LTKP29376 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LTKP29376 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LTKP29376 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LTKP29376 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LTKP29376 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LTKP29376 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LTKP29376 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LTKP29376 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LTKP29376 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LTKP29376 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LTKP29376 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LTKP29376 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LTKP29376 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LTKP29376 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LTKP29376 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LTKP29376 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
LTKP29376 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LTKP29376 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LTKP29376 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LTKP29376 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LTKP29376 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LTKP29376 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LTKP29376 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LTKP29376 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LTKP29376 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LTKP29376 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LTKP29376 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LTKP29376 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LTKP29376 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LTKP29376 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
LTKP29376 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LTKP29376 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LTKP29376 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LTKP29376 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LTKP29376 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LTKP29376 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LTKP29376 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LTKP29376 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LTKP29376 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LTKP29376 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LTKP29376 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LTKP29376 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LTKP29376 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LTKP29376 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LTKP29376 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LTKP29376 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LTKP29376 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LTKP29376 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LTKP29376 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LTKP29376 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LTKP29376 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LTKP29376 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LTKP29376 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LTKP29376 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LTKP29376 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LTKP29376 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LTKP29376 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms