Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms