Protein–RNA interactions for Protein: P21810

BGN, Biglycan, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BGNP21810 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BGNP21810 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BGNP21810 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BGNP21810 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BGNP21810 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BGNP21810 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BGNP21810 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BGNP21810 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BGNP21810 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BGNP21810 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BGNP21810 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BGNP21810 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
BGNP21810 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BGNP21810 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BGNP21810 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BGNP21810 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BGNP21810 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BGNP21810 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BGNP21810 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BGNP21810 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BGNP21810 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BGNP21810 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
BGNP21810 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BGNP21810 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BGNP21810 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BGNP21810 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BGNP21810 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BGNP21810 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BGNP21810 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BGNP21810 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BGNP21810 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BGNP21810 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BGNP21810 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BGNP21810 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BGNP21810 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BGNP21810 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BGNP21810 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BGNP21810 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BGNP21810 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
BGNP21810 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BGNP21810 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BGNP21810 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BGNP21810 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BGNP21810 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BGNP21810 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BGNP21810 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BGNP21810 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BGNP21810 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BGNP21810 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BGNP21810 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BGNP21810 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BGNP21810 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BGNP21810 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BGNP21810 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BGNP21810 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
BGNP21810 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
BGNP21810 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
BGNP21810 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BGNP21810 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
BGNP21810 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BGNP21810 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BGNP21810 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
BGNP21810 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BGNP21810 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BGNP21810 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BGNP21810 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BGNP21810 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BGNP21810 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BGNP21810 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BGNP21810 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BGNP21810 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BGNP21810 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
BGNP21810 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BGNP21810 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BGNP21810 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BGNP21810 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BGNP21810 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BGNP21810 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BGNP21810 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BGNP21810 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BGNP21810 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BGNP21810 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BGNP21810 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BGNP21810 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BGNP21810 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BGNP21810 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
BGNP21810 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BGNP21810 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BGNP21810 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BGNP21810 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BGNP21810 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BGNP21810 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BGNP21810 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
BGNP21810 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BGNP21810 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BGNP21810 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BGNP21810 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BGNP21810 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BGNP21810 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BGNP21810 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms