Protein–RNA interactions for Protein: P17480

UBTF, Nucleolar transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBTFP17480 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
UBTFP17480 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
UBTFP17480 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
UBTFP17480 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
UBTFP17480 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
UBTFP17480 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
UBTFP17480 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
UBTFP17480 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
UBTFP17480 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
UBTFP17480 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
UBTFP17480 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
UBTFP17480 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
UBTFP17480 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
UBTFP17480 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
UBTFP17480 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
UBTFP17480 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
UBTFP17480 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
UBTFP17480 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
UBTFP17480 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
UBTFP17480 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
UBTFP17480 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UBTFP17480 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UBTFP17480 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
UBTFP17480 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UBTFP17480 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC26■■□□□ 1.75
UBTFP17480 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UBTFP17480 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UBTFP17480 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UBTFP17480 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UBTFP17480 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UBTFP17480 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UBTFP17480 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UBTFP17480 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
UBTFP17480 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
UBTFP17480 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UBTFP17480 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
UBTFP17480 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
UBTFP17480 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UBTFP17480 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
UBTFP17480 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UBTFP17480 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
UBTFP17480 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UBTFP17480 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UBTFP17480 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UBTFP17480 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UBTFP17480 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
UBTFP17480 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UBTFP17480 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBTFP17480 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBTFP17480 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBTFP17480 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
UBTFP17480 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBTFP17480 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBTFP17480 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBTFP17480 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBTFP17480 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBTFP17480 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBTFP17480 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBTFP17480 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBTFP17480 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
UBTFP17480 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBTFP17480 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
UBTFP17480 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBTFP17480 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBTFP17480 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
UBTFP17480 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
UBTFP17480 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
UBTFP17480 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBTFP17480 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
UBTFP17480 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBTFP17480 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBTFP17480 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBTFP17480 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBTFP17480 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBTFP17480 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBTFP17480 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBTFP17480 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBTFP17480 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBTFP17480 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBTFP17480 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBTFP17480 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBTFP17480 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBTFP17480 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBTFP17480 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBTFP17480 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBTFP17480 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBTFP17480 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBTFP17480 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBTFP17480 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBTFP17480 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
UBTFP17480 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBTFP17480 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBTFP17480 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBTFP17480 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBTFP17480 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBTFP17480 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBTFP17480 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
UBTFP17480 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
UBTFP17480 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
UBTFP17480 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms