Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms