Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
DENRO43583 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
DENRO43583 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15□□□□□ -0.01
DENRO43583 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DENRO43583 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DENRO43583 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DENRO43583 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
DENRO43583 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DENRO43583 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
DENRO43583 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
DENRO43583 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DENRO43583 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
DENRO43583 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DENRO43583 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DENRO43583 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
DENRO43583 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DENRO43583 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
DENRO43583 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DENRO43583 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DENRO43583 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
DENRO43583 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DENRO43583 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DENRO43583 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DENRO43583 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DENRO43583 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DENRO43583 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15□□□□□ -0.01
DENRO43583 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DENRO43583 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DENRO43583 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DENRO43583 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DENRO43583 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
DENRO43583 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
DENRO43583 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DENRO43583 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DENRO43583 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DENRO43583 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DENRO43583 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
DENRO43583 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
DENRO43583 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DENRO43583 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
DENRO43583 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DENRO43583 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DENRO43583 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
DENRO43583 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DENRO43583 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
DENRO43583 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
DENRO43583 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DENRO43583 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DENRO43583 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DENRO43583 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
DENRO43583 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DENRO43583 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
DENRO43583 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
DENRO43583 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
DENRO43583 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
DENRO43583 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
DENRO43583 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
DENRO43583 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
DENRO43583 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DENRO43583 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
DENRO43583 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
DENRO43583 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
DENRO43583 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DENRO43583 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
DENRO43583 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
DENRO43583 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DENRO43583 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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DENRO43583 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DENRO43583 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DENRO43583 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DENRO43583 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
DENRO43583 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
DENRO43583 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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DENRO43583 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
DENRO43583 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
DENRO43583 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
DENRO43583 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
DENRO43583 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
DENRO43583 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
DENRO43583 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
DENRO43583 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
DENRO43583 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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DENRO43583 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
DENRO43583 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
DENRO43583 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
DENRO43583 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
DENRO43583 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
DENRO43583 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
DENRO43583 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
DENRO43583 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
DENRO43583 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
DENRO43583 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
DENRO43583 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
DENRO43583 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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