Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ABCF2Q9UG63 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ABCF2Q9UG63 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ABCF2Q9UG63 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
ABCF2Q9UG63 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ABCF2Q9UG63 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ABCF2Q9UG63 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ABCF2Q9UG63 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
ABCF2Q9UG63 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ABCF2Q9UG63 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ABCF2Q9UG63 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ABCF2Q9UG63 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
ABCF2Q9UG63 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ABCF2Q9UG63 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ABCF2Q9UG63 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ABCF2Q9UG63 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ABCF2Q9UG63 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
ABCF2Q9UG63 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
ABCF2Q9UG63 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
ABCF2Q9UG63 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ABCF2Q9UG63 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ABCF2Q9UG63 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ABCF2Q9UG63 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ABCF2Q9UG63 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ABCF2Q9UG63 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ABCF2Q9UG63 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ABCF2Q9UG63 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
ABCF2Q9UG63 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ABCF2Q9UG63 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ABCF2Q9UG63 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ABCF2Q9UG63 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ABCF2Q9UG63 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ABCF2Q9UG63 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ABCF2Q9UG63 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ABCF2Q9UG63 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ABCF2Q9UG63 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ABCF2Q9UG63 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ABCF2Q9UG63 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ABCF2Q9UG63 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ABCF2Q9UG63 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ABCF2Q9UG63 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ABCF2Q9UG63 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ABCF2Q9UG63 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ABCF2Q9UG63 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ABCF2Q9UG63 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ABCF2Q9UG63 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ABCF2Q9UG63 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ABCF2Q9UG63 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ABCF2Q9UG63 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
ABCF2Q9UG63 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ABCF2Q9UG63 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ABCF2Q9UG63 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ABCF2Q9UG63 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ABCF2Q9UG63 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ABCF2Q9UG63 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ABCF2Q9UG63 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ABCF2Q9UG63 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ABCF2Q9UG63 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ABCF2Q9UG63 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
ABCF2Q9UG63 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ABCF2Q9UG63 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ABCF2Q9UG63 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ABCF2Q9UG63 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ABCF2Q9UG63 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ABCF2Q9UG63 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ABCF2Q9UG63 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ABCF2Q9UG63 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ABCF2Q9UG63 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ABCF2Q9UG63 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ABCF2Q9UG63 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ABCF2Q9UG63 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ABCF2Q9UG63 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
ABCF2Q9UG63 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
ABCF2Q9UG63 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ABCF2Q9UG63 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ABCF2Q9UG63 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ABCF2Q9UG63 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ABCF2Q9UG63 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ABCF2Q9UG63 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ABCF2Q9UG63 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
ABCF2Q9UG63 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ABCF2Q9UG63 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ABCF2Q9UG63 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ABCF2Q9UG63 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ABCF2Q9UG63 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ABCF2Q9UG63 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
ABCF2Q9UG63 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
ABCF2Q9UG63 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ABCF2Q9UG63 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ABCF2Q9UG63 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ABCF2Q9UG63 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ABCF2Q9UG63 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ABCF2Q9UG63 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ABCF2Q9UG63 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ABCF2Q9UG63 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ABCF2Q9UG63 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ABCF2Q9UG63 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ABCF2Q9UG63 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ABCF2Q9UG63 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ABCF2Q9UG63 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms