Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB2

KRT84, Keratin, type II cuticular Hb4, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT84Q9NSB2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
KRT84Q9NSB2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KRT84Q9NSB2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KRT84Q9NSB2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KRT84Q9NSB2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KRT84Q9NSB2 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KRT84Q9NSB2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KRT84Q9NSB2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KRT84Q9NSB2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KRT84Q9NSB2 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KRT84Q9NSB2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KRT84Q9NSB2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KRT84Q9NSB2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KRT84Q9NSB2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KRT84Q9NSB2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KRT84Q9NSB2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KRT84Q9NSB2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KRT84Q9NSB2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KRT84Q9NSB2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KRT84Q9NSB2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KRT84Q9NSB2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KRT84Q9NSB2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KRT84Q9NSB2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KRT84Q9NSB2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KRT84Q9NSB2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
KRT84Q9NSB2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KRT84Q9NSB2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KRT84Q9NSB2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KRT84Q9NSB2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KRT84Q9NSB2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRT84Q9NSB2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRT84Q9NSB2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRT84Q9NSB2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
KRT84Q9NSB2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRT84Q9NSB2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
KRT84Q9NSB2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
KRT84Q9NSB2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
KRT84Q9NSB2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
KRT84Q9NSB2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
KRT84Q9NSB2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
KRT84Q9NSB2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
KRT84Q9NSB2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
KRT84Q9NSB2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRT84Q9NSB2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRT84Q9NSB2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRT84Q9NSB2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KRT84Q9NSB2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KRT84Q9NSB2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KRT84Q9NSB2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KRT84Q9NSB2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KRT84Q9NSB2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KRT84Q9NSB2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KRT84Q9NSB2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRT84Q9NSB2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRT84Q9NSB2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRT84Q9NSB2 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRT84Q9NSB2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRT84Q9NSB2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRT84Q9NSB2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRT84Q9NSB2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRT84Q9NSB2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRT84Q9NSB2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRT84Q9NSB2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
KRT84Q9NSB2 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRT84Q9NSB2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRT84Q9NSB2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRT84Q9NSB2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRT84Q9NSB2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRT84Q9NSB2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRT84Q9NSB2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRT84Q9NSB2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRT84Q9NSB2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
KRT84Q9NSB2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRT84Q9NSB2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRT84Q9NSB2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRT84Q9NSB2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRT84Q9NSB2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRT84Q9NSB2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRT84Q9NSB2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRT84Q9NSB2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRT84Q9NSB2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRT84Q9NSB2 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRT84Q9NSB2 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRT84Q9NSB2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRT84Q9NSB2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRT84Q9NSB2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRT84Q9NSB2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRT84Q9NSB2 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRT84Q9NSB2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
KRT84Q9NSB2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRT84Q9NSB2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRT84Q9NSB2 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRT84Q9NSB2 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
KRT84Q9NSB2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRT84Q9NSB2 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRT84Q9NSB2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRT84Q9NSB2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT84Q9NSB2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT84Q9NSB2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT84Q9NSB2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122 ms