Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H8

Cul2, Cullin-2, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul2Q9D4H8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cul2Q9D4H8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cul2Q9D4H8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cul2Q9D4H8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cul2Q9D4H8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Cul2Q9D4H8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cul2Q9D4H8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cul2Q9D4H8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cul2Q9D4H8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cul2Q9D4H8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cul2Q9D4H8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cul2Q9D4H8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cul2Q9D4H8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cul2Q9D4H8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cul2Q9D4H8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cul2Q9D4H8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cul2Q9D4H8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cul2Q9D4H8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cul2Q9D4H8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cul2Q9D4H8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cul2Q9D4H8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cul2Q9D4H8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cul2Q9D4H8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cul2Q9D4H8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cul2Q9D4H8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cul2Q9D4H8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cul2Q9D4H8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cul2Q9D4H8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cul2Q9D4H8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cul2Q9D4H8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cul2Q9D4H8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cul2Q9D4H8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cul2Q9D4H8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cul2Q9D4H8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cul2Q9D4H8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cul2Q9D4H8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cul2Q9D4H8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Cul2Q9D4H8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cul2Q9D4H8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cul2Q9D4H8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cul2Q9D4H8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cul2Q9D4H8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cul2Q9D4H8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cul2Q9D4H8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cul2Q9D4H8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Cul2Q9D4H8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cul2Q9D4H8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cul2Q9D4H8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cul2Q9D4H8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cul2Q9D4H8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cul2Q9D4H8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cul2Q9D4H8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cul2Q9D4H8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cul2Q9D4H8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cul2Q9D4H8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cul2Q9D4H8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cul2Q9D4H8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cul2Q9D4H8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cul2Q9D4H8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cul2Q9D4H8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Cul2Q9D4H8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cul2Q9D4H8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cul2Q9D4H8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cul2Q9D4H8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cul2Q9D4H8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cul2Q9D4H8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cul2Q9D4H8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cul2Q9D4H8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cul2Q9D4H8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cul2Q9D4H8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Cul2Q9D4H8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cul2Q9D4H8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Cul2Q9D4H8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cul2Q9D4H8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Cul2Q9D4H8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cul2Q9D4H8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cul2Q9D4H8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cul2Q9D4H8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cul2Q9D4H8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cul2Q9D4H8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cul2Q9D4H8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cul2Q9D4H8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cul2Q9D4H8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cul2Q9D4H8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cul2Q9D4H8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Cul2Q9D4H8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cul2Q9D4H8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cul2Q9D4H8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cul2Q9D4H8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cul2Q9D4H8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cul2Q9D4H8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cul2Q9D4H8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cul2Q9D4H8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cul2Q9D4H8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cul2Q9D4H8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cul2Q9D4H8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cul2Q9D4H8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cul2Q9D4H8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cul2Q9D4H8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cul2Q9D4H8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms