Protein–RNA interactions for Protein: Q99567

NUP88, Nuclear pore complex protein Nup88, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP88Q99567 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
NUP88Q99567 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NUP88Q99567 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NUP88Q99567 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NUP88Q99567 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
NUP88Q99567 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
NUP88Q99567 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NUP88Q99567 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NUP88Q99567 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NUP88Q99567 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NUP88Q99567 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NUP88Q99567 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NUP88Q99567 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NUP88Q99567 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NUP88Q99567 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NUP88Q99567 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NUP88Q99567 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NUP88Q99567 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
NUP88Q99567 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
NUP88Q99567 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NUP88Q99567 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NUP88Q99567 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NUP88Q99567 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NUP88Q99567 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NUP88Q99567 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NUP88Q99567 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NUP88Q99567 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NUP88Q99567 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NUP88Q99567 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NUP88Q99567 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NUP88Q99567 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NUP88Q99567 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NUP88Q99567 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NUP88Q99567 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NUP88Q99567 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NUP88Q99567 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NUP88Q99567 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
NUP88Q99567 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NUP88Q99567 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NUP88Q99567 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NUP88Q99567 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NUP88Q99567 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
NUP88Q99567 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NUP88Q99567 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NUP88Q99567 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NUP88Q99567 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NUP88Q99567 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NUP88Q99567 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NUP88Q99567 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NUP88Q99567 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
NUP88Q99567 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NUP88Q99567 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NUP88Q99567 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.57■■■□□ 2
NUP88Q99567 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NUP88Q99567 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NUP88Q99567 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
NUP88Q99567 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
NUP88Q99567 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NUP88Q99567 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NUP88Q99567 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NUP88Q99567 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
NUP88Q99567 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.55■■■□□ 2
NUP88Q99567 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NUP88Q99567 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NUP88Q99567 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NUP88Q99567 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NUP88Q99567 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NUP88Q99567 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NUP88Q99567 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
NUP88Q99567 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.54■■■□□ 2
NUP88Q99567 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NUP88Q99567 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NUP88Q99567 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NUP88Q99567 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NUP88Q99567 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NUP88Q99567 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NUP88Q99567 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NUP88Q99567 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NUP88Q99567 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
NUP88Q99567 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NUP88Q99567 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NUP88Q99567 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.52■■■□□ 2
NUP88Q99567 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
NUP88Q99567 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.52■■■□□ 2
NUP88Q99567 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NUP88Q99567 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NUP88Q99567 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NUP88Q99567 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NUP88Q99567 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NUP88Q99567 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NUP88Q99567 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NUP88Q99567 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NUP88Q99567 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NUP88Q99567 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NUP88Q99567 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NUP88Q99567 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NUP88Q99567 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NUP88Q99567 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
NUP88Q99567 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NUP88Q99567 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms