Protein–RNA interactions for Protein: Q96MN9

ZNF488, Zinc finger protein 488, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF488Q96MN9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF488Q96MN9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF488Q96MN9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF488Q96MN9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF488Q96MN9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF488Q96MN9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF488Q96MN9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF488Q96MN9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF488Q96MN9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF488Q96MN9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF488Q96MN9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ZNF488Q96MN9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF488Q96MN9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF488Q96MN9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ZNF488Q96MN9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF488Q96MN9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF488Q96MN9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF488Q96MN9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF488Q96MN9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF488Q96MN9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF488Q96MN9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF488Q96MN9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF488Q96MN9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF488Q96MN9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF488Q96MN9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF488Q96MN9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF488Q96MN9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF488Q96MN9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF488Q96MN9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF488Q96MN9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF488Q96MN9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF488Q96MN9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF488Q96MN9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF488Q96MN9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF488Q96MN9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF488Q96MN9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF488Q96MN9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF488Q96MN9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF488Q96MN9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF488Q96MN9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF488Q96MN9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF488Q96MN9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF488Q96MN9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF488Q96MN9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF488Q96MN9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF488Q96MN9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF488Q96MN9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF488Q96MN9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF488Q96MN9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF488Q96MN9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF488Q96MN9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF488Q96MN9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF488Q96MN9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF488Q96MN9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF488Q96MN9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF488Q96MN9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF488Q96MN9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF488Q96MN9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF488Q96MN9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF488Q96MN9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF488Q96MN9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF488Q96MN9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF488Q96MN9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF488Q96MN9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF488Q96MN9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF488Q96MN9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF488Q96MN9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF488Q96MN9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF488Q96MN9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF488Q96MN9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF488Q96MN9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF488Q96MN9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF488Q96MN9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF488Q96MN9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF488Q96MN9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF488Q96MN9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF488Q96MN9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF488Q96MN9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF488Q96MN9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF488Q96MN9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF488Q96MN9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF488Q96MN9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF488Q96MN9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF488Q96MN9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF488Q96MN9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF488Q96MN9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF488Q96MN9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF488Q96MN9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF488Q96MN9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF488Q96MN9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF488Q96MN9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF488Q96MN9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF488Q96MN9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF488Q96MN9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF488Q96MN9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF488Q96MN9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF488Q96MN9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF488Q96MN9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF488Q96MN9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF488Q96MN9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms