Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH8

NEURL3, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL3, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL3Q96EH8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEURL3Q96EH8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEURL3Q96EH8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEURL3Q96EH8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEURL3Q96EH8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEURL3Q96EH8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEURL3Q96EH8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEURL3Q96EH8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEURL3Q96EH8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEURL3Q96EH8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NEURL3Q96EH8 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NEURL3Q96EH8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NEURL3Q96EH8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEURL3Q96EH8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEURL3Q96EH8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEURL3Q96EH8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEURL3Q96EH8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEURL3Q96EH8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEURL3Q96EH8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEURL3Q96EH8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEURL3Q96EH8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NEURL3Q96EH8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEURL3Q96EH8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEURL3Q96EH8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEURL3Q96EH8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEURL3Q96EH8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEURL3Q96EH8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEURL3Q96EH8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEURL3Q96EH8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEURL3Q96EH8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEURL3Q96EH8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEURL3Q96EH8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NEURL3Q96EH8 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEURL3Q96EH8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEURL3Q96EH8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEURL3Q96EH8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NEURL3Q96EH8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEURL3Q96EH8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEURL3Q96EH8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEURL3Q96EH8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEURL3Q96EH8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEURL3Q96EH8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEURL3Q96EH8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEURL3Q96EH8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEURL3Q96EH8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEURL3Q96EH8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NEURL3Q96EH8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEURL3Q96EH8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEURL3Q96EH8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NEURL3Q96EH8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEURL3Q96EH8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEURL3Q96EH8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEURL3Q96EH8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEURL3Q96EH8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEURL3Q96EH8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEURL3Q96EH8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEURL3Q96EH8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEURL3Q96EH8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEURL3Q96EH8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEURL3Q96EH8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NEURL3Q96EH8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEURL3Q96EH8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEURL3Q96EH8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEURL3Q96EH8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEURL3Q96EH8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEURL3Q96EH8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEURL3Q96EH8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEURL3Q96EH8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NEURL3Q96EH8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEURL3Q96EH8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEURL3Q96EH8 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NEURL3Q96EH8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEURL3Q96EH8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEURL3Q96EH8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEURL3Q96EH8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEURL3Q96EH8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEURL3Q96EH8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEURL3Q96EH8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEURL3Q96EH8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEURL3Q96EH8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEURL3Q96EH8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEURL3Q96EH8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEURL3Q96EH8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEURL3Q96EH8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEURL3Q96EH8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEURL3Q96EH8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEURL3Q96EH8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEURL3Q96EH8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEURL3Q96EH8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEURL3Q96EH8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEURL3Q96EH8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEURL3Q96EH8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEURL3Q96EH8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEURL3Q96EH8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEURL3Q96EH8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEURL3Q96EH8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEURL3Q96EH8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEURL3Q96EH8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEURL3Q96EH8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEURL3Q96EH8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms