Protein–RNA interactions for Protein: Q92664

GTF3A, Transcription factor IIIA, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3AQ92664 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF3AQ92664 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF3AQ92664 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GTF3AQ92664 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GTF3AQ92664 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GTF3AQ92664 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GTF3AQ92664 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF3AQ92664 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF3AQ92664 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF3AQ92664 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF3AQ92664 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF3AQ92664 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF3AQ92664 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF3AQ92664 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF3AQ92664 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF3AQ92664 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF3AQ92664 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF3AQ92664 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF3AQ92664 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF3AQ92664 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF3AQ92664 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF3AQ92664 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF3AQ92664 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF3AQ92664 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF3AQ92664 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF3AQ92664 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF3AQ92664 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF3AQ92664 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GTF3AQ92664 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GTF3AQ92664 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GTF3AQ92664 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GTF3AQ92664 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GTF3AQ92664 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GTF3AQ92664 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GTF3AQ92664 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GTF3AQ92664 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GTF3AQ92664 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GTF3AQ92664 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GTF3AQ92664 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF3AQ92664 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF3AQ92664 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF3AQ92664 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF3AQ92664 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF3AQ92664 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF3AQ92664 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF3AQ92664 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF3AQ92664 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF3AQ92664 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF3AQ92664 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF3AQ92664 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF3AQ92664 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF3AQ92664 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF3AQ92664 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF3AQ92664 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF3AQ92664 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF3AQ92664 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF3AQ92664 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF3AQ92664 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF3AQ92664 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF3AQ92664 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
GTF3AQ92664 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
GTF3AQ92664 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF3AQ92664 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF3AQ92664 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF3AQ92664 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF3AQ92664 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF3AQ92664 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF3AQ92664 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF3AQ92664 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF3AQ92664 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF3AQ92664 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF3AQ92664 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF3AQ92664 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF3AQ92664 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF3AQ92664 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF3AQ92664 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF3AQ92664 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF3AQ92664 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF3AQ92664 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF3AQ92664 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF3AQ92664 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF3AQ92664 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF3AQ92664 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF3AQ92664 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF3AQ92664 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF3AQ92664 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF3AQ92664 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF3AQ92664 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF3AQ92664 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF3AQ92664 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF3AQ92664 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF3AQ92664 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF3AQ92664 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF3AQ92664 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF3AQ92664 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF3AQ92664 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF3AQ92664 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF3AQ92664 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF3AQ92664 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF3AQ92664 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms