Protein–RNA interactions for Protein: Q92574

TSC1, Hamartin, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC1Q92574 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TSC1Q92574 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TSC1Q92574 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TSC1Q92574 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TSC1Q92574 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TSC1Q92574 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TSC1Q92574 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TSC1Q92574 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TSC1Q92574 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TSC1Q92574 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TSC1Q92574 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TSC1Q92574 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TSC1Q92574 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TSC1Q92574 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TSC1Q92574 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TSC1Q92574 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TSC1Q92574 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TSC1Q92574 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TSC1Q92574 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TSC1Q92574 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TSC1Q92574 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TSC1Q92574 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TSC1Q92574 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TSC1Q92574 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TSC1Q92574 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TSC1Q92574 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TSC1Q92574 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TSC1Q92574 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TSC1Q92574 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TSC1Q92574 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TSC1Q92574 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TSC1Q92574 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TSC1Q92574 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TSC1Q92574 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TSC1Q92574 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TSC1Q92574 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TSC1Q92574 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TSC1Q92574 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TSC1Q92574 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TSC1Q92574 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TSC1Q92574 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TSC1Q92574 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TSC1Q92574 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TSC1Q92574 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TSC1Q92574 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TSC1Q92574 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TSC1Q92574 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TSC1Q92574 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TSC1Q92574 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TSC1Q92574 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TSC1Q92574 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TSC1Q92574 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TSC1Q92574 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TSC1Q92574 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TSC1Q92574 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TSC1Q92574 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TSC1Q92574 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TSC1Q92574 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TSC1Q92574 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TSC1Q92574 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TSC1Q92574 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TSC1Q92574 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TSC1Q92574 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TSC1Q92574 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TSC1Q92574 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TSC1Q92574 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TSC1Q92574 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TSC1Q92574 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TSC1Q92574 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TSC1Q92574 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TSC1Q92574 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TSC1Q92574 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TSC1Q92574 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TSC1Q92574 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TSC1Q92574 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TSC1Q92574 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TSC1Q92574 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TSC1Q92574 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TSC1Q92574 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TSC1Q92574 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TSC1Q92574 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TSC1Q92574 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TSC1Q92574 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TSC1Q92574 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TSC1Q92574 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TSC1Q92574 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TSC1Q92574 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TSC1Q92574 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TSC1Q92574 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TSC1Q92574 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TSC1Q92574 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TSC1Q92574 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TSC1Q92574 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TSC1Q92574 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TSC1Q92574 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TSC1Q92574 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TSC1Q92574 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TSC1Q92574 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TSC1Q92574 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TSC1Q92574 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms