Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND23

CARMIL3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL3Q8ND23 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
CARMIL3Q8ND23 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
CARMIL3Q8ND23 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
CARMIL3Q8ND23 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
CARMIL3Q8ND23 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CARMIL3Q8ND23 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
CARMIL3Q8ND23 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CARMIL3Q8ND23 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CARMIL3Q8ND23 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CARMIL3Q8ND23 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CARMIL3Q8ND23 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
CARMIL3Q8ND23 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CARMIL3Q8ND23 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CARMIL3Q8ND23 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CARMIL3Q8ND23 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CARMIL3Q8ND23 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CARMIL3Q8ND23 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CARMIL3Q8ND23 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CARMIL3Q8ND23 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CARMIL3Q8ND23 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CARMIL3Q8ND23 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CARMIL3Q8ND23 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
CARMIL3Q8ND23 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CARMIL3Q8ND23 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CARMIL3Q8ND23 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CARMIL3Q8ND23 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CARMIL3Q8ND23 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
CARMIL3Q8ND23 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CARMIL3Q8ND23 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
CARMIL3Q8ND23 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
CARMIL3Q8ND23 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
CARMIL3Q8ND23 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CARMIL3Q8ND23 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
CARMIL3Q8ND23 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CARMIL3Q8ND23 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CARMIL3Q8ND23 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CARMIL3Q8ND23 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CARMIL3Q8ND23 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CARMIL3Q8ND23 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CARMIL3Q8ND23 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CARMIL3Q8ND23 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CARMIL3Q8ND23 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CARMIL3Q8ND23 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CARMIL3Q8ND23 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CARMIL3Q8ND23 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CARMIL3Q8ND23 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CARMIL3Q8ND23 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CARMIL3Q8ND23 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CARMIL3Q8ND23 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CARMIL3Q8ND23 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CARMIL3Q8ND23 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
CARMIL3Q8ND23 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CARMIL3Q8ND23 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CARMIL3Q8ND23 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CARMIL3Q8ND23 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CARMIL3Q8ND23 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
CARMIL3Q8ND23 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CARMIL3Q8ND23 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CARMIL3Q8ND23 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CARMIL3Q8ND23 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CARMIL3Q8ND23 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CARMIL3Q8ND23 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CARMIL3Q8ND23 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CARMIL3Q8ND23 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CARMIL3Q8ND23 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CARMIL3Q8ND23 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CARMIL3Q8ND23 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
CARMIL3Q8ND23 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CARMIL3Q8ND23 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CARMIL3Q8ND23 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CARMIL3Q8ND23 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CARMIL3Q8ND23 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CARMIL3Q8ND23 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CARMIL3Q8ND23 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CARMIL3Q8ND23 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CARMIL3Q8ND23 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CARMIL3Q8ND23 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CARMIL3Q8ND23 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CARMIL3Q8ND23 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CARMIL3Q8ND23 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CARMIL3Q8ND23 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
CARMIL3Q8ND23 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CARMIL3Q8ND23 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CARMIL3Q8ND23 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CARMIL3Q8ND23 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CARMIL3Q8ND23 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CARMIL3Q8ND23 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CARMIL3Q8ND23 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CARMIL3Q8ND23 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CARMIL3Q8ND23 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CARMIL3Q8ND23 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CARMIL3Q8ND23 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CARMIL3Q8ND23 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CARMIL3Q8ND23 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CARMIL3Q8ND23 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CARMIL3Q8ND23 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CARMIL3Q8ND23 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CARMIL3Q8ND23 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CARMIL3Q8ND23 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CARMIL3Q8ND23 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms