Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp20Q8C6M1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp20Q8C6M1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp20Q8C6M1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp20Q8C6M1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp20Q8C6M1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp20Q8C6M1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp20Q8C6M1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Usp20Q8C6M1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Usp20Q8C6M1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Usp20Q8C6M1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp20Q8C6M1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp20Q8C6M1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp20Q8C6M1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp20Q8C6M1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp20Q8C6M1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp20Q8C6M1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp20Q8C6M1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp20Q8C6M1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp20Q8C6M1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp20Q8C6M1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp20Q8C6M1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp20Q8C6M1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp20Q8C6M1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp20Q8C6M1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp20Q8C6M1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp20Q8C6M1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp20Q8C6M1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp20Q8C6M1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp20Q8C6M1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp20Q8C6M1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp20Q8C6M1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp20Q8C6M1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp20Q8C6M1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp20Q8C6M1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp20Q8C6M1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp20Q8C6M1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp20Q8C6M1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp20Q8C6M1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp20Q8C6M1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp20Q8C6M1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp20Q8C6M1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp20Q8C6M1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp20Q8C6M1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp20Q8C6M1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Usp20Q8C6M1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Usp20Q8C6M1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Usp20Q8C6M1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Usp20Q8C6M1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Usp20Q8C6M1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Usp20Q8C6M1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp20Q8C6M1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp20Q8C6M1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp20Q8C6M1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp20Q8C6M1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp20Q8C6M1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp20Q8C6M1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp20Q8C6M1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp20Q8C6M1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp20Q8C6M1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp20Q8C6M1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp20Q8C6M1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp20Q8C6M1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp20Q8C6M1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp20Q8C6M1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp20Q8C6M1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp20Q8C6M1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp20Q8C6M1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp20Q8C6M1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp20Q8C6M1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp20Q8C6M1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp20Q8C6M1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp20Q8C6M1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp20Q8C6M1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp20Q8C6M1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp20Q8C6M1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp20Q8C6M1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp20Q8C6M1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp20Q8C6M1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp20Q8C6M1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp20Q8C6M1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp20Q8C6M1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp20Q8C6M1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp20Q8C6M1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp20Q8C6M1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp20Q8C6M1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp20Q8C6M1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp20Q8C6M1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp20Q8C6M1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp20Q8C6M1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp20Q8C6M1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp20Q8C6M1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp20Q8C6M1 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp20Q8C6M1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp20Q8C6M1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp20Q8C6M1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp20Q8C6M1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp20Q8C6M1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp20Q8C6M1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp20Q8C6M1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms