Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Z0

KRT25, Keratin, type I cytoskeletal 25, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT25Q7Z3Z0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KRT25Q7Z3Z0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KRT25Q7Z3Z0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KRT25Q7Z3Z0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KRT25Q7Z3Z0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KRT25Q7Z3Z0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KRT25Q7Z3Z0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KRT25Q7Z3Z0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KRT25Q7Z3Z0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KRT25Q7Z3Z0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KRT25Q7Z3Z0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KRT25Q7Z3Z0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KRT25Q7Z3Z0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
KRT25Q7Z3Z0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KRT25Q7Z3Z0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KRT25Q7Z3Z0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KRT25Q7Z3Z0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KRT25Q7Z3Z0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KRT25Q7Z3Z0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KRT25Q7Z3Z0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
KRT25Q7Z3Z0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KRT25Q7Z3Z0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KRT25Q7Z3Z0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KRT25Q7Z3Z0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KRT25Q7Z3Z0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KRT25Q7Z3Z0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KRT25Q7Z3Z0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KRT25Q7Z3Z0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KRT25Q7Z3Z0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KRT25Q7Z3Z0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
KRT25Q7Z3Z0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
KRT25Q7Z3Z0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
KRT25Q7Z3Z0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
KRT25Q7Z3Z0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
KRT25Q7Z3Z0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
KRT25Q7Z3Z0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
KRT25Q7Z3Z0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
KRT25Q7Z3Z0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
KRT25Q7Z3Z0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
KRT25Q7Z3Z0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KRT25Q7Z3Z0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KRT25Q7Z3Z0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KRT25Q7Z3Z0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KRT25Q7Z3Z0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KRT25Q7Z3Z0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KRT25Q7Z3Z0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
KRT25Q7Z3Z0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
KRT25Q7Z3Z0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
KRT25Q7Z3Z0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
KRT25Q7Z3Z0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KRT25Q7Z3Z0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KRT25Q7Z3Z0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KRT25Q7Z3Z0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KRT25Q7Z3Z0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KRT25Q7Z3Z0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KRT25Q7Z3Z0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KRT25Q7Z3Z0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KRT25Q7Z3Z0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KRT25Q7Z3Z0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KRT25Q7Z3Z0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KRT25Q7Z3Z0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KRT25Q7Z3Z0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KRT25Q7Z3Z0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KRT25Q7Z3Z0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KRT25Q7Z3Z0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KRT25Q7Z3Z0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KRT25Q7Z3Z0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KRT25Q7Z3Z0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KRT25Q7Z3Z0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KRT25Q7Z3Z0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KRT25Q7Z3Z0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KRT25Q7Z3Z0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KRT25Q7Z3Z0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
KRT25Q7Z3Z0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KRT25Q7Z3Z0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KRT25Q7Z3Z0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KRT25Q7Z3Z0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
KRT25Q7Z3Z0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KRT25Q7Z3Z0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KRT25Q7Z3Z0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
KRT25Q7Z3Z0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
KRT25Q7Z3Z0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
KRT25Q7Z3Z0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
KRT25Q7Z3Z0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
KRT25Q7Z3Z0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
KRT25Q7Z3Z0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
KRT25Q7Z3Z0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
KRT25Q7Z3Z0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KRT25Q7Z3Z0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
KRT25Q7Z3Z0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
KRT25Q7Z3Z0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KRT25Q7Z3Z0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KRT25Q7Z3Z0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KRT25Q7Z3Z0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KRT25Q7Z3Z0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KRT25Q7Z3Z0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
KRT25Q7Z3Z0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KRT25Q7Z3Z0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KRT25Q7Z3Z0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KRT25Q7Z3Z0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms