Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1X6

C8orf82, UPF0598 protein C8orf82, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf82Q6P1X6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
C8orf82Q6P1X6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
C8orf82Q6P1X6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
C8orf82Q6P1X6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C8orf82Q6P1X6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C8orf82Q6P1X6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C8orf82Q6P1X6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C8orf82Q6P1X6 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C8orf82Q6P1X6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C8orf82Q6P1X6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C8orf82Q6P1X6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C8orf82Q6P1X6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C8orf82Q6P1X6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C8orf82Q6P1X6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C8orf82Q6P1X6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C8orf82Q6P1X6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C8orf82Q6P1X6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C8orf82Q6P1X6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C8orf82Q6P1X6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C8orf82Q6P1X6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C8orf82Q6P1X6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C8orf82Q6P1X6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C8orf82Q6P1X6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C8orf82Q6P1X6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C8orf82Q6P1X6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C8orf82Q6P1X6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C8orf82Q6P1X6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C8orf82Q6P1X6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C8orf82Q6P1X6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C8orf82Q6P1X6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C8orf82Q6P1X6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C8orf82Q6P1X6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C8orf82Q6P1X6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C8orf82Q6P1X6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C8orf82Q6P1X6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C8orf82Q6P1X6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C8orf82Q6P1X6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C8orf82Q6P1X6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C8orf82Q6P1X6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C8orf82Q6P1X6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C8orf82Q6P1X6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C8orf82Q6P1X6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C8orf82Q6P1X6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C8orf82Q6P1X6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C8orf82Q6P1X6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C8orf82Q6P1X6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C8orf82Q6P1X6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C8orf82Q6P1X6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C8orf82Q6P1X6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C8orf82Q6P1X6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C8orf82Q6P1X6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C8orf82Q6P1X6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C8orf82Q6P1X6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
C8orf82Q6P1X6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C8orf82Q6P1X6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C8orf82Q6P1X6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C8orf82Q6P1X6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C8orf82Q6P1X6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C8orf82Q6P1X6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C8orf82Q6P1X6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C8orf82Q6P1X6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C8orf82Q6P1X6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C8orf82Q6P1X6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C8orf82Q6P1X6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C8orf82Q6P1X6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C8orf82Q6P1X6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C8orf82Q6P1X6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C8orf82Q6P1X6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C8orf82Q6P1X6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C8orf82Q6P1X6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C8orf82Q6P1X6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C8orf82Q6P1X6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C8orf82Q6P1X6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C8orf82Q6P1X6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C8orf82Q6P1X6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C8orf82Q6P1X6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
C8orf82Q6P1X6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C8orf82Q6P1X6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C8orf82Q6P1X6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C8orf82Q6P1X6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C8orf82Q6P1X6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C8orf82Q6P1X6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C8orf82Q6P1X6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C8orf82Q6P1X6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C8orf82Q6P1X6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C8orf82Q6P1X6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
C8orf82Q6P1X6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C8orf82Q6P1X6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C8orf82Q6P1X6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
C8orf82Q6P1X6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C8orf82Q6P1X6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C8orf82Q6P1X6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
C8orf82Q6P1X6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C8orf82Q6P1X6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C8orf82Q6P1X6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C8orf82Q6P1X6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C8orf82Q6P1X6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C8orf82Q6P1X6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C8orf82Q6P1X6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C8orf82Q6P1X6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms