Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXP0

EFCAB12, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB12Q6NXP0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
EFCAB12Q6NXP0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
EFCAB12Q6NXP0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
EFCAB12Q6NXP0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
EFCAB12Q6NXP0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
EFCAB12Q6NXP0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
EFCAB12Q6NXP0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
EFCAB12Q6NXP0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
EFCAB12Q6NXP0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
EFCAB12Q6NXP0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
EFCAB12Q6NXP0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
EFCAB12Q6NXP0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
EFCAB12Q6NXP0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
EFCAB12Q6NXP0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
EFCAB12Q6NXP0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
EFCAB12Q6NXP0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
EFCAB12Q6NXP0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
EFCAB12Q6NXP0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
EFCAB12Q6NXP0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
EFCAB12Q6NXP0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
EFCAB12Q6NXP0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
EFCAB12Q6NXP0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
EFCAB12Q6NXP0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
EFCAB12Q6NXP0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
EFCAB12Q6NXP0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
EFCAB12Q6NXP0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
EFCAB12Q6NXP0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
EFCAB12Q6NXP0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
EFCAB12Q6NXP0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
EFCAB12Q6NXP0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
EFCAB12Q6NXP0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
EFCAB12Q6NXP0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
EFCAB12Q6NXP0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
EFCAB12Q6NXP0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
EFCAB12Q6NXP0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
EFCAB12Q6NXP0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
EFCAB12Q6NXP0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
EFCAB12Q6NXP0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
EFCAB12Q6NXP0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
EFCAB12Q6NXP0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
EFCAB12Q6NXP0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EFCAB12Q6NXP0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
EFCAB12Q6NXP0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EFCAB12Q6NXP0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
EFCAB12Q6NXP0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
EFCAB12Q6NXP0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EFCAB12Q6NXP0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EFCAB12Q6NXP0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EFCAB12Q6NXP0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EFCAB12Q6NXP0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
EFCAB12Q6NXP0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EFCAB12Q6NXP0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EFCAB12Q6NXP0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
EFCAB12Q6NXP0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EFCAB12Q6NXP0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
EFCAB12Q6NXP0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EFCAB12Q6NXP0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EFCAB12Q6NXP0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
EFCAB12Q6NXP0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EFCAB12Q6NXP0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EFCAB12Q6NXP0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
EFCAB12Q6NXP0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
EFCAB12Q6NXP0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EFCAB12Q6NXP0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
EFCAB12Q6NXP0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EFCAB12Q6NXP0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
EFCAB12Q6NXP0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EFCAB12Q6NXP0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
EFCAB12Q6NXP0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
EFCAB12Q6NXP0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
EFCAB12Q6NXP0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
EFCAB12Q6NXP0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
EFCAB12Q6NXP0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
EFCAB12Q6NXP0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
EFCAB12Q6NXP0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EFCAB12Q6NXP0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
EFCAB12Q6NXP0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EFCAB12Q6NXP0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EFCAB12Q6NXP0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EFCAB12Q6NXP0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EFCAB12Q6NXP0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
EFCAB12Q6NXP0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EFCAB12Q6NXP0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
EFCAB12Q6NXP0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
EFCAB12Q6NXP0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
EFCAB12Q6NXP0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
EFCAB12Q6NXP0 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
EFCAB12Q6NXP0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
EFCAB12Q6NXP0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
EFCAB12Q6NXP0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
EFCAB12Q6NXP0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EFCAB12Q6NXP0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
EFCAB12Q6NXP0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
EFCAB12Q6NXP0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
EFCAB12Q6NXP0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EFCAB12Q6NXP0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
EFCAB12Q6NXP0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EFCAB12Q6NXP0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EFCAB12Q6NXP0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
EFCAB12Q6NXP0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.5 ms