Protein–RNA interactions for Protein: Q68D06

SLFN13, Schlafen family member 13, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN13Q68D06 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SLFN13Q68D06 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SLFN13Q68D06 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SLFN13Q68D06 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SLFN13Q68D06 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SLFN13Q68D06 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SLFN13Q68D06 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SLFN13Q68D06 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SLFN13Q68D06 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SLFN13Q68D06 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SLFN13Q68D06 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SLFN13Q68D06 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SLFN13Q68D06 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SLFN13Q68D06 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SLFN13Q68D06 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SLFN13Q68D06 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
SLFN13Q68D06 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SLFN13Q68D06 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SLFN13Q68D06 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SLFN13Q68D06 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SLFN13Q68D06 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SLFN13Q68D06 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
SLFN13Q68D06 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SLFN13Q68D06 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SLFN13Q68D06 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SLFN13Q68D06 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SLFN13Q68D06 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SLFN13Q68D06 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SLFN13Q68D06 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
SLFN13Q68D06 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
SLFN13Q68D06 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLFN13Q68D06 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLFN13Q68D06 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLFN13Q68D06 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLFN13Q68D06 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLFN13Q68D06 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
SLFN13Q68D06 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLFN13Q68D06 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLFN13Q68D06 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLFN13Q68D06 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SLFN13Q68D06 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLFN13Q68D06 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLFN13Q68D06 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLFN13Q68D06 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SLFN13Q68D06 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLFN13Q68D06 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLFN13Q68D06 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLFN13Q68D06 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLFN13Q68D06 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLFN13Q68D06 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLFN13Q68D06 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLFN13Q68D06 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLFN13Q68D06 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLFN13Q68D06 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLFN13Q68D06 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLFN13Q68D06 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLFN13Q68D06 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLFN13Q68D06 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLFN13Q68D06 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLFN13Q68D06 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLFN13Q68D06 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLFN13Q68D06 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLFN13Q68D06 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLFN13Q68D06 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLFN13Q68D06 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLFN13Q68D06 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLFN13Q68D06 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLFN13Q68D06 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLFN13Q68D06 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLFN13Q68D06 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLFN13Q68D06 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLFN13Q68D06 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLFN13Q68D06 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
SLFN13Q68D06 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLFN13Q68D06 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SLFN13Q68D06 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SLFN13Q68D06 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SLFN13Q68D06 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SLFN13Q68D06 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SLFN13Q68D06 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SLFN13Q68D06 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLFN13Q68D06 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLFN13Q68D06 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLFN13Q68D06 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLFN13Q68D06 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SLFN13Q68D06 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLFN13Q68D06 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLFN13Q68D06 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLFN13Q68D06 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLFN13Q68D06 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLFN13Q68D06 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLFN13Q68D06 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLFN13Q68D06 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLFN13Q68D06 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLFN13Q68D06 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLFN13Q68D06 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLFN13Q68D06 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLFN13Q68D06 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLFN13Q68D06 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SLFN13Q68D06 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms