Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTQ8

Cdkl5, Cyclin-dependent kinase-like 5, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl5Q3UTQ8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cdkl5Q3UTQ8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cdkl5Q3UTQ8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cdkl5Q3UTQ8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cdkl5Q3UTQ8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cdkl5Q3UTQ8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cdkl5Q3UTQ8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cdkl5Q3UTQ8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cdkl5Q3UTQ8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cdkl5Q3UTQ8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cdkl5Q3UTQ8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cdkl5Q3UTQ8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cdkl5Q3UTQ8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cdkl5Q3UTQ8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cdkl5Q3UTQ8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdkl5Q3UTQ8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdkl5Q3UTQ8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdkl5Q3UTQ8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdkl5Q3UTQ8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdkl5Q3UTQ8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdkl5Q3UTQ8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdkl5Q3UTQ8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Cdkl5Q3UTQ8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cdkl5Q3UTQ8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cdkl5Q3UTQ8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cdkl5Q3UTQ8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cdkl5Q3UTQ8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cdkl5Q3UTQ8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cdkl5Q3UTQ8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cdkl5Q3UTQ8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cdkl5Q3UTQ8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cdkl5Q3UTQ8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cdkl5Q3UTQ8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cdkl5Q3UTQ8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cdkl5Q3UTQ8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cdkl5Q3UTQ8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cdkl5Q3UTQ8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cdkl5Q3UTQ8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cdkl5Q3UTQ8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cdkl5Q3UTQ8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cdkl5Q3UTQ8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cdkl5Q3UTQ8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cdkl5Q3UTQ8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cdkl5Q3UTQ8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cdkl5Q3UTQ8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cdkl5Q3UTQ8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Cdkl5Q3UTQ8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cdkl5Q3UTQ8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cdkl5Q3UTQ8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cdkl5Q3UTQ8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cdkl5Q3UTQ8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cdkl5Q3UTQ8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cdkl5Q3UTQ8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cdkl5Q3UTQ8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cdkl5Q3UTQ8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cdkl5Q3UTQ8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cdkl5Q3UTQ8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cdkl5Q3UTQ8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cdkl5Q3UTQ8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cdkl5Q3UTQ8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cdkl5Q3UTQ8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cdkl5Q3UTQ8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cdkl5Q3UTQ8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cdkl5Q3UTQ8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cdkl5Q3UTQ8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cdkl5Q3UTQ8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cdkl5Q3UTQ8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cdkl5Q3UTQ8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cdkl5Q3UTQ8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cdkl5Q3UTQ8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cdkl5Q3UTQ8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cdkl5Q3UTQ8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cdkl5Q3UTQ8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdkl5Q3UTQ8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdkl5Q3UTQ8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdkl5Q3UTQ8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdkl5Q3UTQ8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdkl5Q3UTQ8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdkl5Q3UTQ8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdkl5Q3UTQ8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdkl5Q3UTQ8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdkl5Q3UTQ8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdkl5Q3UTQ8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdkl5Q3UTQ8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdkl5Q3UTQ8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdkl5Q3UTQ8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cdkl5Q3UTQ8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cdkl5Q3UTQ8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cdkl5Q3UTQ8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cdkl5Q3UTQ8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Cdkl5Q3UTQ8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cdkl5Q3UTQ8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cdkl5Q3UTQ8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cdkl5Q3UTQ8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cdkl5Q3UTQ8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cdkl5Q3UTQ8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cdkl5Q3UTQ8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cdkl5Q3UTQ8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cdkl5Q3UTQ8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cdkl5Q3UTQ8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms