Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX39BQ13838 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX39BQ13838 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX39BQ13838 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX39BQ13838 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX39BQ13838 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX39BQ13838 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX39BQ13838 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX39BQ13838 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX39BQ13838 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX39BQ13838 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX39BQ13838 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX39BQ13838 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX39BQ13838 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX39BQ13838 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX39BQ13838 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX39BQ13838 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX39BQ13838 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX39BQ13838 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX39BQ13838 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX39BQ13838 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX39BQ13838 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX39BQ13838 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX39BQ13838 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX39BQ13838 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX39BQ13838 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX39BQ13838 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX39BQ13838 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX39BQ13838 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX39BQ13838 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX39BQ13838 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX39BQ13838 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX39BQ13838 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX39BQ13838 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX39BQ13838 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX39BQ13838 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX39BQ13838 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX39BQ13838 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX39BQ13838 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX39BQ13838 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX39BQ13838 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX39BQ13838 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX39BQ13838 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
DDX39BQ13838 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
DDX39BQ13838 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDX39BQ13838 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDX39BQ13838 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDX39BQ13838 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDX39BQ13838 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDX39BQ13838 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDX39BQ13838 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDX39BQ13838 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDX39BQ13838 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDX39BQ13838 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDX39BQ13838 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDX39BQ13838 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX39BQ13838 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX39BQ13838 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX39BQ13838 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDX39BQ13838 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDX39BQ13838 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDX39BQ13838 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDX39BQ13838 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDX39BQ13838 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDX39BQ13838 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDX39BQ13838 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDX39BQ13838 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
DDX39BQ13838 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDX39BQ13838 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDX39BQ13838 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDX39BQ13838 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDX39BQ13838 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDX39BQ13838 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDX39BQ13838 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDX39BQ13838 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDX39BQ13838 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
DDX39BQ13838 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDX39BQ13838 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDX39BQ13838 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDX39BQ13838 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDX39BQ13838 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDX39BQ13838 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDX39BQ13838 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
DDX39BQ13838 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
DDX39BQ13838 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
DDX39BQ13838 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDX39BQ13838 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
DDX39BQ13838 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DDX39BQ13838 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
DDX39BQ13838 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
DDX39BQ13838 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DDX39BQ13838 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
DDX39BQ13838 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DDX39BQ13838 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
DDX39BQ13838 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDX39BQ13838 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDX39BQ13838 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDX39BQ13838 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDX39BQ13838 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDX39BQ13838 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
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