Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CNTN1Q12860 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CNTN1Q12860 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CNTN1Q12860 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CNTN1Q12860 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNTN1Q12860 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNTN1Q12860 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNTN1Q12860 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CNTN1Q12860 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNTN1Q12860 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNTN1Q12860 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNTN1Q12860 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNTN1Q12860 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNTN1Q12860 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNTN1Q12860 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNTN1Q12860 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNTN1Q12860 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNTN1Q12860 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CNTN1Q12860 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNTN1Q12860 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CNTN1Q12860 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CNTN1Q12860 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNTN1Q12860 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNTN1Q12860 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNTN1Q12860 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNTN1Q12860 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNTN1Q12860 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNTN1Q12860 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNTN1Q12860 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CNTN1Q12860 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CNTN1Q12860 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNTN1Q12860 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNTN1Q12860 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CNTN1Q12860 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNTN1Q12860 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNTN1Q12860 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNTN1Q12860 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNTN1Q12860 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNTN1Q12860 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNTN1Q12860 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNTN1Q12860 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNTN1Q12860 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNTN1Q12860 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNTN1Q12860 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNTN1Q12860 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CNTN1Q12860 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNTN1Q12860 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CNTN1Q12860 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNTN1Q12860 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNTN1Q12860 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNTN1Q12860 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNTN1Q12860 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CNTN1Q12860 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNTN1Q12860 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNTN1Q12860 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNTN1Q12860 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNTN1Q12860 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNTN1Q12860 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNTN1Q12860 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNTN1Q12860 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNTN1Q12860 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNTN1Q12860 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CNTN1Q12860 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNTN1Q12860 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CNTN1Q12860 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNTN1Q12860 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNTN1Q12860 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNTN1Q12860 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNTN1Q12860 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNTN1Q12860 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNTN1Q12860 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNTN1Q12860 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNTN1Q12860 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNTN1Q12860 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNTN1Q12860 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNTN1Q12860 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNTN1Q12860 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNTN1Q12860 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNTN1Q12860 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNTN1Q12860 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNTN1Q12860 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNTN1Q12860 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CNTN1Q12860 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNTN1Q12860 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNTN1Q12860 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNTN1Q12860 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNTN1Q12860 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNTN1Q12860 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CNTN1Q12860 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNTN1Q12860 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNTN1Q12860 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNTN1Q12860 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNTN1Q12860 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNTN1Q12860 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNTN1Q12860 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CNTN1Q12860 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNTN1Q12860 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNTN1Q12860 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNTN1Q12860 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNTN1Q12860 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
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