Protein–RNA interactions for Protein: Q08962

NIP7, 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NIP7Q08962 LDB19YOR322C 2457 nt4.89□□□□□ -1.63
NIP7Q08962 PAP2YOL115W 1755 nt4.89□□□□□ -1.63
NIP7Q08962 HSX1tR(CCU)J 72 nt4.89□□□□□ -1.63
NIP7Q08962 PGA3YML125C 939 nt4.89□□□□□ -1.63
NIP7Q08962 IRS4YKR019C 1848 nt4.88□□□□□ -1.63
NIP7Q08962 HIR1YBL008W 2523 nt4.88□□□□□ -1.63
NIP7Q08962 NUD1YOR373W 2556 nt4.88□□□□□ -1.63
NIP7Q08962 YCR097W-AYCR097W-A 267 nt4.88□□□□□ -1.63
NIP7Q08962 YLL059CYLL059C 507 nt4.88□□□□□ -1.63
NIP7Q08962 HST2YPL015C 1074 nt4.88□□□□□ -1.63
NIP7Q08962 RGD1YBR260C 2001 nt4.88□□□□□ -1.63
NIP7Q08962 GYP1YOR070C 1914 nt4.87□□□□□ -1.63
NIP7Q08962 UGO1YDR470C 1509 nt4.87□□□□□ -1.63
NIP7Q08962 VHT1YGR065C 1782 nt4.87□□□□□ -1.63
NIP7Q08962 COX26YDR119W-A 201 nt4.87□□□□□ -1.63
NIP7Q08962 SIP2YGL208W 1248 nt4.87□□□□□ -1.63
NIP7Q08962 BRL1YHR036W 1416 nt4.87□□□□□ -1.63
NIP7Q08962 DON1YDR273W 1098 nt4.86□□□□□ -1.63
NIP7Q08962 PGU1YJR153W 1086 nt4.86□□□□□ -1.63
NIP7Q08962 DCN1YLR128W 810 nt4.86□□□□□ -1.63
NIP7Q08962 TFS1YLR178C 660 nt4.86□□□□□ -1.63
NIP7Q08962 YEL020CYEL020C 1683 nt4.86□□□□□ -1.63
NIP7Q08962 HXT17YNR072W 1695 nt4.86□□□□□ -1.63
NIP7Q08962 RHB1YCR027C 630 nt4.85□□□□□ -1.63
NIP7Q08962 SFC1YJR095W 969 nt4.85□□□□□ -1.63
NIP7Q08962 DAL82YNL314W 768 nt4.85□□□□□ -1.63
NIP7Q08962 YPR195CYPR195C 330 nt4.85□□□□□ -1.63
NIP7Q08962 YBR230W-AYBR230W-A 201 nt4.85□□□□□ -1.63
NIP7Q08962 HAS1YMR290C 1518 nt4.85□□□□□ -1.63
NIP7Q08962 UTP7YER082C 1665 nt4.85□□□□□ -1.63
NIP7Q08962 SHE10YGL228W 1734 nt4.85□□□□□ -1.63
NIP7Q08962 BAP2YBR068C 1830 nt4.85□□□□□ -1.63
NIP7Q08962 VTH1YIL173W 4650 nt4.85□□□□□ -1.63
NIP7Q08962 VTH2YJL222W 4650 nt4.85□□□□□ -1.63
NIP7Q08962 SSK1YLR006C 2139 nt4.84□□□□□ -1.63
NIP7Q08962 ENT2YLR206W 1842 nt4.84□□□□□ -1.63
NIP7Q08962 UTP18YJL069C 1785 nt4.84□□□□□ -1.63
NIP7Q08962 KTR5YNL029C 1569 nt4.84□□□□□ -1.63
NIP7Q08962 CAD1YDR423C 1230 nt4.84□□□□□ -1.63
NIP7Q08962 YGR176WYGR176W 348 nt4.84□□□□□ -1.63
NIP7Q08962 EMW1YNL313C 2715 nt4.83□□□□□ -1.64
NIP7Q08962 YDL034WYDL034W 345 nt4.83□□□□□ -1.64
NIP7Q08962 MTQ2YDR140W 666 nt4.83□□□□□ -1.64
NIP7Q08962 COG1YGL223C 1254 nt4.83□□□□□ -1.64
NIP7Q08962 tN(GUU)CtN(GUU)C 74 nt4.83□□□□□ -1.64
NIP7Q08962 tN(GUU)FtN(GUU)F 74 nt4.83□□□□□ -1.64
NIP7Q08962 tN(GUU)GtN(GUU)G 74 nt4.83□□□□□ -1.64
NIP7Q08962 tN(GUU)KtN(GUU)K 74 nt4.83□□□□□ -1.64
NIP7Q08962 tN(GUU)LtN(GUU)L 74 nt4.83□□□□□ -1.64
NIP7Q08962 tN(GUU)N1tN(GUU)N1 74 nt4.83□□□□□ -1.64
NIP7Q08962 tN(GUU)N2tN(GUU)N2 74 nt4.83□□□□□ -1.64
NIP7Q08962 tN(GUU)O1tN(GUU)O1 74 nt4.83□□□□□ -1.64
NIP7Q08962 tN(GUU)O2tN(GUU)O2 74 nt4.83□□□□□ -1.64
NIP7Q08962 tN(GUU)PtN(GUU)P 74 nt4.83□□□□□ -1.64
NIP7Q08962 YIL077CYIL077C 963 nt4.83□□□□□ -1.64
NIP7Q08962 YNR048WYNR048W 1182 nt4.83□□□□□ -1.64
NIP7Q08962 PSH1YOL054W 1221 nt4.83□□□□□ -1.64
NIP7Q08962 ALT1YLR089C 1779 nt4.83□□□□□ -1.64
NIP7Q08962 MSS1YMR023C 1581 nt4.82□□□□□ -1.64
NIP7Q08962 YGL036WYGL036W 2730 nt4.82□□□□□ -1.64
NIP7Q08962 ADY2YCR010C 852 nt4.82□□□□□ -1.64
NIP7Q08962 EFM4YIL064W 774 nt4.82□□□□□ -1.64
NIP7Q08962 ESC8YOL017W 2145 nt4.82□□□□□ -1.64
NIP7Q08962 MTC5YDR128W 3447 nt4.81□□□□□ -1.64
NIP7Q08962 RTT106YNL206C 1368 nt4.81□□□□□ -1.64
NIP7Q08962 GEP3YOR205C 1671 nt4.81□□□□□ -1.64
NIP7Q08962 SCW4YGR279C 1161 nt4.81□□□□□ -1.64
NIP7Q08962 YIL060WYIL060W 435 nt4.81□□□□□ -1.64
NIP7Q08962 UBC4YBR082C 447 nt4.81□□□□□ -1.64
NIP7Q08962 RRT2YBR246W 1164 nt4.81□□□□□ -1.64
NIP7Q08962 RPT1YKL145W 1404 nt4.8□□□□□ -1.64
NIP7Q08962 YAP1801YHR161C 1914 nt4.8□□□□□ -1.64
NIP7Q08962 YJR115WYJR115W 510 nt4.8□□□□□ -1.64
NIP7Q08962 RHO2YNL090W 579 nt4.8□□□□□ -1.64
NIP7Q08962 ARG1YOL058W 1263 nt4.8□□□□□ -1.64
NIP7Q08962 YOL097W-AYOL097W-A 186 nt4.8□□□□□ -1.64
NIP7Q08962 TFB4YPR056W 1017 nt4.8□□□□□ -1.64
NIP7Q08962 GEX1YCL073C 1848 nt4.8□□□□□ -1.64
NIP7Q08962 GEX2YKR106W 1848 nt4.8□□□□□ -1.64
NIP7Q08962 SKN1YGR143W 2316 nt4.8□□□□□ -1.64
NIP7Q08962 CSC1YLR241W 2349 nt4.79□□□□□ -1.64
NIP7Q08962 PTK2YJR059W 2457 nt4.79□□□□□ -1.64
NIP7Q08962 RSA4YCR072C 1548 nt4.79□□□□□ -1.64
NIP7Q08962 ALD6YPL061W 1503 nt4.79□□□□□ -1.64
NIP7Q08962 YDL023CYDL023C 321 nt4.79□□□□□ -1.64
NIP7Q08962 YDR541CYDR541C 1035 nt4.79□□□□□ -1.64
NIP7Q08962 COS9YKL219W 1224 nt4.79□□□□□ -1.64
NIP7Q08962 CBC2YPL178W 627 nt4.79□□□□□ -1.64
NIP7Q08962 SAC6YDR129C 1929 nt4.79□□□□□ -1.64
NIP7Q08962 AMA1YGR225W 1782 nt4.78□□□□□ -1.64
NIP7Q08962 DED81YHR019C 1665 nt4.78□□□□□ -1.64
NIP7Q08962 YHR045WYHR045W 1683 nt4.78□□□□□ -1.64
NIP7Q08962 HEM3YDL205C 984 nt4.78□□□□□ -1.64
NIP7Q08962 HOR7YMR251W-A 180 nt4.78□□□□□ -1.64
NIP7Q08962 PGA2YNL149C 390 nt4.78□□□□□ -1.64
NIP7Q08962 SSK22YCR073C 3996 nt4.78□□□□□ -1.64
NIP7Q08962 DEF1YKL054C 2217 nt4.77□□□□□ -1.65
NIP7Q08962 TBF1YPL128C 1689 nt4.77□□□□□ -1.65
NIP7Q08962 RMD9YGL107C 1941 nt4.77□□□□□ -1.65
NIP7Q08962 TAX4YJL083W 1815 nt4.76□□□□□ -1.65
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