Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SSRP1Q08945 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SSRP1Q08945 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SSRP1Q08945 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SSRP1Q08945 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SSRP1Q08945 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SSRP1Q08945 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SSRP1Q08945 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SSRP1Q08945 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SSRP1Q08945 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SSRP1Q08945 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SSRP1Q08945 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SSRP1Q08945 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SSRP1Q08945 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SSRP1Q08945 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SSRP1Q08945 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SSRP1Q08945 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SSRP1Q08945 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SSRP1Q08945 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SSRP1Q08945 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SSRP1Q08945 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SSRP1Q08945 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SSRP1Q08945 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SSRP1Q08945 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SSRP1Q08945 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SSRP1Q08945 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SSRP1Q08945 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SSRP1Q08945 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SSRP1Q08945 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SSRP1Q08945 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SSRP1Q08945 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SSRP1Q08945 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
SSRP1Q08945 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SSRP1Q08945 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SSRP1Q08945 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SSRP1Q08945 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SSRP1Q08945 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SSRP1Q08945 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SSRP1Q08945 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SSRP1Q08945 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SSRP1Q08945 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SSRP1Q08945 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SSRP1Q08945 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SSRP1Q08945 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SSRP1Q08945 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SSRP1Q08945 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SSRP1Q08945 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SSRP1Q08945 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SSRP1Q08945 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SSRP1Q08945 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SSRP1Q08945 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SSRP1Q08945 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SSRP1Q08945 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SSRP1Q08945 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SSRP1Q08945 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SSRP1Q08945 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SSRP1Q08945 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SSRP1Q08945 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SSRP1Q08945 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SSRP1Q08945 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SSRP1Q08945 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SSRP1Q08945 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SSRP1Q08945 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SSRP1Q08945 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SSRP1Q08945 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SSRP1Q08945 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SSRP1Q08945 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SSRP1Q08945 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SSRP1Q08945 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SSRP1Q08945 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SSRP1Q08945 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SSRP1Q08945 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SSRP1Q08945 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SSRP1Q08945 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SSRP1Q08945 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SSRP1Q08945 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SSRP1Q08945 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SSRP1Q08945 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SSRP1Q08945 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SSRP1Q08945 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SSRP1Q08945 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SSRP1Q08945 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SSRP1Q08945 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SSRP1Q08945 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SSRP1Q08945 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SSRP1Q08945 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SSRP1Q08945 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SSRP1Q08945 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SSRP1Q08945 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SSRP1Q08945 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SSRP1Q08945 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SSRP1Q08945 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SSRP1Q08945 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SSRP1Q08945 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
SSRP1Q08945 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SSRP1Q08945 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SSRP1Q08945 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SSRP1Q08945 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SSRP1Q08945 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SSRP1Q08945 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms