Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CD300CQ08708 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CD300CQ08708 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CD300CQ08708 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CD300CQ08708 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CD300CQ08708 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CD300CQ08708 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CD300CQ08708 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CD300CQ08708 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CD300CQ08708 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CD300CQ08708 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CD300CQ08708 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CD300CQ08708 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CD300CQ08708 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CD300CQ08708 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CD300CQ08708 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CD300CQ08708 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CD300CQ08708 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CD300CQ08708 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CD300CQ08708 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CD300CQ08708 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CD300CQ08708 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CD300CQ08708 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CD300CQ08708 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CD300CQ08708 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CD300CQ08708 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CD300CQ08708 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CD300CQ08708 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CD300CQ08708 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CD300CQ08708 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CD300CQ08708 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CD300CQ08708 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CD300CQ08708 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CD300CQ08708 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CD300CQ08708 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CD300CQ08708 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CD300CQ08708 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CD300CQ08708 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CD300CQ08708 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CD300CQ08708 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CD300CQ08708 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CD300CQ08708 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CD300CQ08708 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CD300CQ08708 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CD300CQ08708 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CD300CQ08708 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CD300CQ08708 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CD300CQ08708 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CD300CQ08708 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CD300CQ08708 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CD300CQ08708 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CD300CQ08708 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CD300CQ08708 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CD300CQ08708 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CD300CQ08708 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CD300CQ08708 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CD300CQ08708 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CD300CQ08708 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CD300CQ08708 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CD300CQ08708 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CD300CQ08708 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CD300CQ08708 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CD300CQ08708 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CD300CQ08708 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CD300CQ08708 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CD300CQ08708 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CD300CQ08708 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CD300CQ08708 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CD300CQ08708 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CD300CQ08708 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CD300CQ08708 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CD300CQ08708 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CD300CQ08708 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CD300CQ08708 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CD300CQ08708 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CD300CQ08708 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CD300CQ08708 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CD300CQ08708 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CD300CQ08708 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CD300CQ08708 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CD300CQ08708 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CD300CQ08708 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CD300CQ08708 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CD300CQ08708 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CD300CQ08708 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CD300CQ08708 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CD300CQ08708 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CD300CQ08708 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CD300CQ08708 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CD300CQ08708 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CD300CQ08708 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CD300CQ08708 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CD300CQ08708 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CD300CQ08708 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CD300CQ08708 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CD300CQ08708 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CD300CQ08708 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CD300CQ08708 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CD300CQ08708 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CD300CQ08708 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms