Protein–RNA interactions for Protein: Q06629

HDA2, HDA1 complex subunit 2, yeastyeast

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HDA2Q06629 YJL144WYJL144W 315 nt6.46□□□□□ -1.38
HDA2Q06629 RSM26YJR101W 801 nt6.46□□□□□ -1.38
HDA2Q06629 YJR107WYJR107W 987 nt6.46□□□□□ -1.38
HDA2Q06629 YLR326WYLR326W 723 nt6.46□□□□□ -1.38
HDA2Q06629 YML122CYML122C 381 nt6.46□□□□□ -1.38
HDA2Q06629 TAP42YMR028W 1101 nt6.46□□□□□ -1.38
HDA2Q06629 YIM2YMR151W 438 nt6.46□□□□□ -1.38
HDA2Q06629 YPL113CYPL113C 1191 nt6.46□□□□□ -1.38
HDA2Q06629 CDC7YDL017W 1524 nt6.45□□□□□ -1.38
HDA2Q06629 COQ6YGR255C 1440 nt6.45□□□□□ -1.38
HDA2Q06629 CBS1YDL069C 690 nt6.45□□□□□ -1.38
HDA2Q06629 ERG25YGR060W 930 nt6.45□□□□□ -1.38
HDA2Q06629 YIR021W-AYIR021W-A 213 nt6.45□□□□□ -1.38
HDA2Q06629 YAL066WYAL066W 309 nt6.45□□□□□ -1.38
HDA2Q06629 PGA2YNL149C 390 nt6.45□□□□□ -1.38
HDA2Q06629 ECM8YBR076W 1065 nt6.45□□□□□ -1.38
HDA2Q06629 NCE102YPR149W 522 nt6.45□□□□□ -1.38
HDA2Q06629 RDR1YOR380W 1641 nt6.45□□□□□ -1.38
HDA2Q06629 MRE11YMR224C 2079 nt6.45□□□□□ -1.38
HDA2Q06629 ERC1YHR032W 1746 nt6.45□□□□□ -1.38
HDA2Q06629 COX20YDR231C 618 nt6.44□□□□□ -1.38
HDA2Q06629 YHR095WYHR095W 495 nt6.44□□□□□ -1.38
HDA2Q06629 YIL089WYIL089W 618 nt6.44□□□□□ -1.38
HDA2Q06629 MTR2YKL186C 555 nt6.44□□□□□ -1.38
HDA2Q06629 MAC1YMR021C 1254 nt6.44□□□□□ -1.38
HDA2Q06629 RUF5-1RUF5-1 710 nt6.44□□□□□ -1.38
HDA2Q06629 RUF5-2RUF5-2 710 nt6.44□□□□□ -1.38
HDA2Q06629 TLG2YOL018C 1194 nt6.44□□□□□ -1.38
HDA2Q06629 SRF1YDL133W 1314 nt6.44□□□□□ -1.38
HDA2Q06629 SIT1YEL065W 1887 nt6.43□□□□□ -1.38
HDA2Q06629 PRR2YDL214C 2100 nt6.43□□□□□ -1.38
HDA2Q06629 ERG20YJL167W 1059 nt6.43□□□□□ -1.38
HDA2Q06629 DID4YKL002W 699 nt6.43□□□□□ -1.38
HDA2Q06629 EBP2YKL172W 1284 nt6.43□□□□□ -1.38
HDA2Q06629 ATG16YMR159C 453 nt6.43□□□□□ -1.38
HDA2Q06629 TOM40YMR203W 1164 nt6.43□□□□□ -1.38
HDA2Q06629 CST26YBR042C 1194 nt6.43□□□□□ -1.38
HDA2Q06629 YPL068CYPL068C 882 nt6.43□□□□□ -1.38
HDA2Q06629 POP4YBR257W 840 nt6.43□□□□□ -1.38
HDA2Q06629 CLP1YOR250C 1338 nt6.43□□□□□ -1.38
HDA2Q06629 FCY2YER056C 1602 nt6.43□□□□□ -1.38
HDA2Q06629 MLF3YNL074C 1359 nt6.43□□□□□ -1.38
HDA2Q06629 IML2YJL082W 2196 nt6.42□□□□□ -1.38
HDA2Q06629 KCH1YJR054W 1494 nt6.42□□□□□ -1.38
HDA2Q06629 ECM1YAL059W 639 nt6.42□□□□□ -1.38
HDA2Q06629 RTC4YNL254C 1206 nt6.42□□□□□ -1.38
HDA2Q06629 YPL191CYPL191C 1083 nt6.42□□□□□ -1.38
HDA2Q06629 RPL43AYPR043W 279 nt6.42□□□□□ -1.38
HDA2Q06629 PRD1YCL057W 2139 nt6.42□□□□□ -1.38
HDA2Q06629 NAF1YNL124W 1479 nt6.41□□□□□ -1.38
HDA2Q06629 PDA1YER178W 1263 nt6.41□□□□□ -1.38
HDA2Q06629 IPI1YHR085W 1005 nt6.41□□□□□ -1.38
HDA2Q06629 HPM1YIL110W 1134 nt6.41□□□□□ -1.38
HDA2Q06629 GMH1YKR030W 822 nt6.41□□□□□ -1.38
HDA2Q06629 UIP3YAR027W 708 nt6.41□□□□□ -1.38
HDA2Q06629 SUR7YML052W 909 nt6.41□□□□□ -1.38
HDA2Q06629 CSM3YMR048W 954 nt6.41□□□□□ -1.38
HDA2Q06629 SNO1YMR095C 675 nt6.41□□□□□ -1.38
HDA2Q06629 YMR144WYMR144W 1029 nt6.41□□□□□ -1.38
HDA2Q06629 END3YNL084C 1050 nt6.41□□□□□ -1.38
HDA2Q06629 CSL4YNL232W 879 nt6.41□□□□□ -1.38
HDA2Q06629 YOR097CYOR097C 528 nt6.41□□□□□ -1.38
HDA2Q06629 YOR111WYOR111W 699 nt6.41□□□□□ -1.38
HDA2Q06629 EMP65YER140W 1671 nt6.41□□□□□ -1.38
HDA2Q06629 GUP2YPL189W 1830 nt6.41□□□□□ -1.38
HDA2Q06629 DRN1YGR093W 1524 nt6.4□□□□□ -1.38
HDA2Q06629 ATR1YML116W 1629 nt6.4□□□□□ -1.38
HDA2Q06629 LCB2YDR062W 1686 nt6.4□□□□□ -1.38
HDA2Q06629 EXG2YDR261C 1689 nt6.4□□□□□ -1.38
HDA2Q06629 FET4YMR319C 1659 nt6.4□□□□□ -1.38
HDA2Q06629 LOT6YLR011W 576 nt6.4□□□□□ -1.38
HDA2Q06629 YNL217WYNL217W 981 nt6.4□□□□□ -1.38
HDA2Q06629 CKB2YOR039W 777 nt6.4□□□□□ -1.38
HDA2Q06629 SMA1YPL027W 738 nt6.4□□□□□ -1.38
HDA2Q06629 DPM1YPR183W 804 nt6.4□□□□□ -1.38
HDA2Q06629 ENB1YOL158C 1821 nt6.4□□□□□ -1.38
HDA2Q06629 YDR034C-CYDR034C-C 1317 nt6.4□□□□□ -1.39
HDA2Q06629 YLR410W-AYLR410W-A 1317 nt6.4□□□□□ -1.39
HDA2Q06629 SGE1YPR198W 1632 nt6.39□□□□□ -1.39
HDA2Q06629 PGI1YBR196C 1665 nt6.39□□□□□ -1.39
HDA2Q06629 SRP101YDR292C 1866 nt6.39□□□□□ -1.39
HDA2Q06629 FAA4YMR246W 2085 nt6.39□□□□□ -1.39
HDA2Q06629 YCR100CYCR100C 951 nt6.39□□□□□ -1.39
HDA2Q06629 YPQ2YDR352W 954 nt6.39□□□□□ -1.39
HDA2Q06629 YLR124WYLR124W 345 nt6.39□□□□□ -1.39
HDA2Q06629 PRS4YBL068W 981 nt6.39□□□□□ -1.39
HDA2Q06629 MCP1YOR228C 909 nt6.39□□□□□ -1.39
HDA2Q06629 snR19snR19 568 nt6.39□□□□□ -1.39
HDA2Q06629 NFS1YCL017C 1494 nt6.39□□□□□ -1.39
HDA2Q06629 AIM3YBR108W 2844 nt6.39□□□□□ -1.39
HDA2Q06629 STL1YDR536W 1710 nt6.39□□□□□ -1.39
HDA2Q06629 MKC7YDR144C 1791 nt6.39□□□□□ -1.39
HDA2Q06629 YCR041WYCR041W 333 nt6.38□□□□□ -1.39
HDA2Q06629 PPH22YDL188C 1134 nt6.38□□□□□ -1.39
HDA2Q06629 ERJ5YFR041C 888 nt6.38□□□□□ -1.39
HDA2Q06629 KEG1YFR042W 603 nt6.38□□□□□ -1.39
HDA2Q06629 SNF4YGL115W 969 nt6.38□□□□□ -1.39
HDA2Q06629 TRR2YHR106W 1029 nt6.38□□□□□ -1.39
HDA2Q06629 YKR073CYKR073C 321 nt6.38□□□□□ -1.39
HDA2Q06629 ERG27YLR100W 1044 nt6.38□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 632 ms