Protein–RNA interactions for Protein: Q03654

CEF1, Pre-mRNA-splicing factor CEF1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CEF1Q03654 CAF40YNL288W 1122 nt6.51□□□□□ -1.37
CEF1Q03654 MMR1YLR190W 1476 nt6.51□□□□□ -1.37
CEF1Q03654 LCB2YDR062W 1686 nt6.51□□□□□ -1.37
CEF1Q03654 VBA1YMR088C 1689 nt6.51□□□□□ -1.37
CEF1Q03654 PCL10YGL134W 1302 nt6.5□□□□□ -1.37
CEF1Q03654 APE1YKL103C 1545 nt6.5□□□□□ -1.37
CEF1Q03654 DIT1YDR403W 1611 nt6.5□□□□□ -1.37
CEF1Q03654 MDM31YHR194W 1740 nt6.5□□□□□ -1.37
CEF1Q03654 RAM1YDL090C 1296 nt6.5□□□□□ -1.37
CEF1Q03654 YEL068CYEL068C 333 nt6.5□□□□□ -1.37
CEF1Q03654 COA1YIL157C 594 nt6.5□□□□□ -1.37
CEF1Q03654 YMR030W-AYMR030W-A 291 nt6.5□□□□□ -1.37
CEF1Q03654 BSC4YNL269W 396 nt6.5□□□□□ -1.37
CEF1Q03654 PRY3YJL078C 2646 nt6.49□□□□□ -1.37
CEF1Q03654 SKI6YGR195W 741 nt6.49□□□□□ -1.37
CEF1Q03654 BUD32YGR262C 786 nt6.49□□□□□ -1.37
CEF1Q03654 LDS1YAL018C 978 nt6.49□□□□□ -1.37
CEF1Q03654 AIM41YOR215C 558 nt6.49□□□□□ -1.37
CEF1Q03654 TIP41YPR040W 1071 nt6.49□□□□□ -1.37
CEF1Q03654 PYK2YOR347C 1521 nt6.49□□□□□ -1.37
CEF1Q03654 RPS16BYDL083C 432 nt6.48□□□□□ -1.37
CEF1Q03654 YDL129WYDL129W 876 nt6.48□□□□□ -1.37
CEF1Q03654 YDR034W-BYDR034W-B 156 nt6.48□□□□□ -1.37
CEF1Q03654 VPS61YDR136C 573 nt6.48□□□□□ -1.37
CEF1Q03654 MRPL24YMR193W 777 nt6.48□□□□□ -1.37
CEF1Q03654 YBL081WYBL081W 1107 nt6.48□□□□□ -1.37
CEF1Q03654 MRPS16YPL013C 366 nt6.48□□□□□ -1.37
CEF1Q03654 WTM1YOR230W 1314 nt6.48□□□□□ -1.37
CEF1Q03654 MAC1YMR021C 1254 nt6.47□□□□□ -1.37
CEF1Q03654 MTQ1YNL063W 945 nt6.47□□□□□ -1.37
CEF1Q03654 MOD5YOR274W 1287 nt6.47□□□□□ -1.37
CEF1Q03654 RRS1YOR294W 612 nt6.47□□□□□ -1.37
CEF1Q03654 COA2YPL189C-A 207 nt6.47□□□□□ -1.37
CEF1Q03654 PMT2YAL023C 2280 nt6.47□□□□□ -1.37
CEF1Q03654 GPI18YBR004C 1302 nt6.47□□□□□ -1.37
CEF1Q03654 GUD1YDL238C 1470 nt6.47□□□□□ -1.37
CEF1Q03654 tR(ACG)DtR(ACG)D 73 nt6.46□□□□□ -1.38
CEF1Q03654 tR(ACG)EtR(ACG)E 73 nt6.46□□□□□ -1.38
CEF1Q03654 tR(ACG)KtR(ACG)K 73 nt6.46□□□□□ -1.38
CEF1Q03654 tR(ACG)LtR(ACG)L 73 nt6.46□□□□□ -1.38
CEF1Q03654 tR(ACG)OtR(ACG)O 73 nt6.46□□□□□ -1.38
CEF1Q03654 RPT1YKL145W 1404 nt6.46□□□□□ -1.38
CEF1Q03654 TSA1YML028W 591 nt6.46□□□□□ -1.38
CEF1Q03654 RGD1YBR260C 2001 nt6.46□□□□□ -1.38
CEF1Q03654 ARH1YDR376W 1482 nt6.46□□□□□ -1.38
CEF1Q03654 PRT1YOR361C 2292 nt6.46□□□□□ -1.38
CEF1Q03654 SKS1YPL026C 1509 nt6.45□□□□□ -1.38
CEF1Q03654 LPL1YOR059C 1353 nt6.45□□□□□ -1.38
CEF1Q03654 RMD9YGL107C 1941 nt6.45□□□□□ -1.38
CEF1Q03654 RSM10YDR041W 612 nt6.45□□□□□ -1.38
CEF1Q03654 HSP150YJL159W 1242 nt6.45□□□□□ -1.38
CEF1Q03654 OSW5YMR148W 447 nt6.45□□□□□ -1.38
CEF1Q03654 YPR160C-AYPR160C-A 285 nt6.45□□□□□ -1.38
CEF1Q03654 HRQ1YDR291W 3234 nt6.45□□□□□ -1.38
CEF1Q03654 SLD2YKL108W 1362 nt6.44□□□□□ -1.38
CEF1Q03654 YBR138CYBR138C 1575 nt6.44□□□□□ -1.38
CEF1Q03654 MPP10YJR002W 1782 nt6.44□□□□□ -1.38
CEF1Q03654 RRP1YDR087C 837 nt6.44□□□□□ -1.38
CEF1Q03654 MRPL1YDR116C 858 nt6.44□□□□□ -1.38
CEF1Q03654 MMS21YEL019C 804 nt6.44□□□□□ -1.38
CEF1Q03654 LEU5YHR002W 1074 nt6.44□□□□□ -1.38
CEF1Q03654 YMR119W-AYMR119W-A 375 nt6.44□□□□□ -1.38
CEF1Q03654 YPR114WYPR114W 948 nt6.44□□□□□ -1.38
CEF1Q03654 RSM23YGL129C 1353 nt6.44□□□□□ -1.38
CEF1Q03654 ABZ1YNR033W 2364 nt6.43□□□□□ -1.38
CEF1Q03654 GPB2YAL056W 2643 nt6.43□□□□□ -1.38
CEF1Q03654 COX20YDR231C 618 nt6.43□□□□□ -1.38
CEF1Q03654 YGL118CYGL118C 438 nt6.43□□□□□ -1.38
CEF1Q03654 YGR176WYGR176W 348 nt6.43□□□□□ -1.38
CEF1Q03654 YIR042CYIR042C 711 nt6.43□□□□□ -1.38
CEF1Q03654 AIM33YML087C 939 nt6.43□□□□□ -1.38
CEF1Q03654 YNL042W-BYNL042W-B 258 nt6.43□□□□□ -1.38
CEF1Q03654 YOL035CYOL035C 303 nt6.43□□□□□ -1.38
CEF1Q03654 UIP4YPL186C 915 nt6.43□□□□□ -1.38
CEF1Q03654 NUD1YOR373W 2556 nt6.43□□□□□ -1.38
CEF1Q03654 VMA13YPR036W 1437 nt6.42□□□□□ -1.38
CEF1Q03654 PHO3YBR092C 1404 nt6.42□□□□□ -1.38
CEF1Q03654 PFK2YMR205C 2880 nt6.42□□□□□ -1.38
CEF1Q03654 MRE11YMR224C 2079 nt6.42□□□□□ -1.38
CEF1Q03654 YCR006CYCR006C 474 nt6.42□□□□□ -1.38
CEF1Q03654 SPC42YKL042W 1092 nt6.42□□□□□ -1.38
CEF1Q03654 PRE2YPR103W 864 nt6.42□□□□□ -1.38
CEF1Q03654 VAN1YML115C 1608 nt6.42□□□□□ -1.38
CEF1Q03654 ATR1YML116W 1629 nt6.42□□□□□ -1.38
CEF1Q03654 ISC1YER019W 1434 nt6.42□□□□□ -1.38
CEF1Q03654 STE12YHR084W 2067 nt6.41□□□□□ -1.38
CEF1Q03654 GIP1YBR045C 1920 nt6.41□□□□□ -1.38
CEF1Q03654 ICT1YLR099C 1185 nt6.41□□□□□ -1.38
CEF1Q03654 HOF1YMR032W 2010 nt6.41□□□□□ -1.38
CEF1Q03654 YMD8YML038C 1329 nt6.41□□□□□ -1.38
CEF1Q03654 VPS1YKR001C 2115 nt6.41□□□□□ -1.38
CEF1Q03654 YDR132CYDR132C 1488 nt6.41□□□□□ -1.38
CEF1Q03654 MNS1YJR131W 1650 nt6.4□□□□□ -1.38
CEF1Q03654 KKQ8YKL168C 2175 nt6.4□□□□□ -1.38
CEF1Q03654 RHO3YIL118W 696 nt6.4□□□□□ -1.38
CEF1Q03654 TOM40YMR203W 1164 nt6.4□□□□□ -1.38
CEF1Q03654 YJR124CYJR124C 1347 nt6.4□□□□□ -1.39
CEF1Q03654 ADE12YNL220W 1302 nt6.4□□□□□ -1.39
CEF1Q03654 RAD24YER173W 1980 nt6.4□□□□□ -1.39
CEF1Q03654 WHI4YDL224C 1950 nt6.39□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 41.2 ms