Protein–RNA interactions for Protein: Q02446

SP4, Transcription factor Sp4, humanhuman

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP4Q02446 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SP4Q02446 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SP4Q02446 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SP4Q02446 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SP4Q02446 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SP4Q02446 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SP4Q02446 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SP4Q02446 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
SP4Q02446 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SP4Q02446 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SP4Q02446 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SP4Q02446 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SP4Q02446 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SP4Q02446 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SP4Q02446 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SP4Q02446 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SP4Q02446 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SP4Q02446 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SP4Q02446 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SP4Q02446 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SP4Q02446 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SP4Q02446 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SP4Q02446 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SP4Q02446 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SP4Q02446 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SP4Q02446 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SP4Q02446 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SP4Q02446 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SP4Q02446 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SP4Q02446 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SP4Q02446 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SP4Q02446 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SP4Q02446 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SP4Q02446 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SP4Q02446 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SP4Q02446 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SP4Q02446 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SP4Q02446 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SP4Q02446 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SP4Q02446 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SP4Q02446 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SP4Q02446 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SP4Q02446 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SP4Q02446 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SP4Q02446 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SP4Q02446 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SP4Q02446 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SP4Q02446 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SP4Q02446 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SP4Q02446 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SP4Q02446 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SP4Q02446 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SP4Q02446 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SP4Q02446 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SP4Q02446 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SP4Q02446 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
SP4Q02446 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SP4Q02446 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SP4Q02446 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SP4Q02446 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SP4Q02446 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SP4Q02446 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SP4Q02446 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SP4Q02446 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SP4Q02446 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SP4Q02446 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SP4Q02446 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SP4Q02446 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
SP4Q02446 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SP4Q02446 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SP4Q02446 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SP4Q02446 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SP4Q02446 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SP4Q02446 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SP4Q02446 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SP4Q02446 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SP4Q02446 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SP4Q02446 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SP4Q02446 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
SP4Q02446 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SP4Q02446 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SP4Q02446 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SP4Q02446 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SP4Q02446 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SP4Q02446 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SP4Q02446 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SP4Q02446 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SP4Q02446 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SP4Q02446 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SP4Q02446 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SP4Q02446 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SP4Q02446 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SP4Q02446 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SP4Q02446 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SP4Q02446 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SP4Q02446 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SP4Q02446 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SP4Q02446 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SP4Q02446 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SP4Q02446 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms