Protein–RNA interactions for Protein: P56539

CAV3, Caveolin-3, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV3P56539 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CAV3P56539 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CAV3P56539 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CAV3P56539 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CAV3P56539 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CAV3P56539 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CAV3P56539 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CAV3P56539 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CAV3P56539 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CAV3P56539 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CAV3P56539 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CAV3P56539 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CAV3P56539 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CAV3P56539 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CAV3P56539 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CAV3P56539 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CAV3P56539 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CAV3P56539 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CAV3P56539 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CAV3P56539 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CAV3P56539 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CAV3P56539 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CAV3P56539 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CAV3P56539 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CAV3P56539 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CAV3P56539 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CAV3P56539 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CAV3P56539 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CAV3P56539 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CAV3P56539 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CAV3P56539 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CAV3P56539 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CAV3P56539 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CAV3P56539 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CAV3P56539 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CAV3P56539 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CAV3P56539 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CAV3P56539 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CAV3P56539 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CAV3P56539 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CAV3P56539 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CAV3P56539 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CAV3P56539 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CAV3P56539 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CAV3P56539 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CAV3P56539 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CAV3P56539 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CAV3P56539 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CAV3P56539 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CAV3P56539 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CAV3P56539 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CAV3P56539 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CAV3P56539 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CAV3P56539 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CAV3P56539 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CAV3P56539 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CAV3P56539 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CAV3P56539 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CAV3P56539 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CAV3P56539 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CAV3P56539 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CAV3P56539 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CAV3P56539 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CAV3P56539 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CAV3P56539 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CAV3P56539 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CAV3P56539 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CAV3P56539 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CAV3P56539 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CAV3P56539 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CAV3P56539 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CAV3P56539 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CAV3P56539 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CAV3P56539 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CAV3P56539 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CAV3P56539 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CAV3P56539 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CAV3P56539 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CAV3P56539 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CAV3P56539 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CAV3P56539 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CAV3P56539 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CAV3P56539 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CAV3P56539 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CAV3P56539 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CAV3P56539 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CAV3P56539 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CAV3P56539 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CAV3P56539 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CAV3P56539 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CAV3P56539 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CAV3P56539 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CAV3P56539 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CAV3P56539 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CAV3P56539 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CAV3P56539 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CAV3P56539 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CAV3P56539 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CAV3P56539 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CAV3P56539 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms