Protein–RNA interactions for Protein: P54727

RAD23B, UV excision repair protein RAD23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23BP54727 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAD23BP54727 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAD23BP54727 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAD23BP54727 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAD23BP54727 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAD23BP54727 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAD23BP54727 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAD23BP54727 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAD23BP54727 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAD23BP54727 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAD23BP54727 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAD23BP54727 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAD23BP54727 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAD23BP54727 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RAD23BP54727 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAD23BP54727 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAD23BP54727 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAD23BP54727 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAD23BP54727 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAD23BP54727 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAD23BP54727 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAD23BP54727 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RAD23BP54727 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RAD23BP54727 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAD23BP54727 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RAD23BP54727 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RAD23BP54727 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAD23BP54727 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAD23BP54727 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAD23BP54727 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAD23BP54727 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAD23BP54727 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAD23BP54727 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RAD23BP54727 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAD23BP54727 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAD23BP54727 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAD23BP54727 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAD23BP54727 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAD23BP54727 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAD23BP54727 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAD23BP54727 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAD23BP54727 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAD23BP54727 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAD23BP54727 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAD23BP54727 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAD23BP54727 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAD23BP54727 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAD23BP54727 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAD23BP54727 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAD23BP54727 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAD23BP54727 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAD23BP54727 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAD23BP54727 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAD23BP54727 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAD23BP54727 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAD23BP54727 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAD23BP54727 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAD23BP54727 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAD23BP54727 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAD23BP54727 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAD23BP54727 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAD23BP54727 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAD23BP54727 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAD23BP54727 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAD23BP54727 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAD23BP54727 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAD23BP54727 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAD23BP54727 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAD23BP54727 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAD23BP54727 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAD23BP54727 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAD23BP54727 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAD23BP54727 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAD23BP54727 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAD23BP54727 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAD23BP54727 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAD23BP54727 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAD23BP54727 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAD23BP54727 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAD23BP54727 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAD23BP54727 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAD23BP54727 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAD23BP54727 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAD23BP54727 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RAD23BP54727 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
RAD23BP54727 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAD23BP54727 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAD23BP54727 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAD23BP54727 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAD23BP54727 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAD23BP54727 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAD23BP54727 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAD23BP54727 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAD23BP54727 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAD23BP54727 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAD23BP54727 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAD23BP54727 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAD23BP54727 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAD23BP54727 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAD23BP54727 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms