Protein–RNA interactions for Protein: P53947

YNL058C, Vacuolar membrane protein YNL058C, yeastyeast

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YNL058CP53947 SUP11tY(GUA)F1 75 nt6.03□□□□□ -1.44
YNL058CP53947 SUP6tY(GUA)F2 75 nt6.03□□□□□ -1.44
YNL058CP53947 SUP7tY(GUA)J1 75 nt6.03□□□□□ -1.44
YNL058CP53947 SUP4tY(GUA)J2 75 nt6.03□□□□□ -1.44
YNL058CP53947 SUP5tY(GUA)M1 75 nt6.03□□□□□ -1.44
YNL058CP53947 SUP8tY(GUA)M2 75 nt6.03□□□□□ -1.44
YNL058CP53947 SUP3tY(GUA)O 75 nt6.03□□□□□ -1.44
YNL058CP53947 YJL107CYJL107C 1164 nt6.03□□□□□ -1.44
YNL058CP53947 YBL081WYBL081W 1107 nt6.03□□□□□ -1.44
YNL058CP53947 PKC1YBL105C 3456 nt6.02□□□□□ -1.44
YNL058CP53947 YDR034W-BYDR034W-B 156 nt6.02□□□□□ -1.45
YNL058CP53947 CBT1YKL208W 816 nt6.02□□□□□ -1.45
YNL058CP53947 COA2YPL189C-A 207 nt6.02□□□□□ -1.45
YNL058CP53947 YPR114WYPR114W 948 nt6.02□□□□□ -1.45
YNL058CP53947 GAT1YFL021W 1533 nt6.02□□□□□ -1.45
YNL058CP53947 FRS2YFL022C 1512 nt6.01□□□□□ -1.45
YNL058CP53947 YER186CYER186C 921 nt6.01□□□□□ -1.45
YNL058CP53947 YMR295CYMR295C 594 nt6.01□□□□□ -1.45
YNL058CP53947 NRM1YNR009W 750 nt6.01□□□□□ -1.45
YNL058CP53947 YNR040WYNR040W 771 nt6.01□□□□□ -1.45
YNL058CP53947 ODC2YOR222W 924 nt6.01□□□□□ -1.45
YNL058CP53947 ARB1YER036C 1833 nt6.01□□□□□ -1.45
YNL058CP53947 RPE1YJL121C 717 nt6□□□□□ -1.45
YNL058CP53947 YJU3YKL094W 942 nt6□□□□□ -1.45
YNL058CP53947 CPA1YOR303W 1236 nt6□□□□□ -1.45
YNL058CP53947 ATG4YNL223W 1485 nt6□□□□□ -1.45
YNL058CP53947 MPP10YJR002W 1782 nt6□□□□□ -1.45
YNL058CP53947 NGL2YMR285C 1548 nt5.99□□□□□ -1.45
YNL058CP53947 MDM31YHR194W 1740 nt5.99□□□□□ -1.45
YNL058CP53947 RRP9YPR137W 1722 nt5.99□□□□□ -1.45
YNL058CP53947 YER147C-AYER147C-A 411 nt5.99□□□□□ -1.45
YNL058CP53947 YGL118CYGL118C 438 nt5.99□□□□□ -1.45
YNL058CP53947 RNH201YNL072W 924 nt5.99□□□□□ -1.45
YNL058CP53947 YOL079WYOL079W 399 nt5.99□□□□□ -1.45
YNL058CP53947 NTH2YBR001C 2343 nt5.99□□□□□ -1.45
YNL058CP53947 DBF2YGR092W 1719 nt5.99□□□□□ -1.45
YNL058CP53947 QRI1YDL103C 1434 nt5.99□□□□□ -1.45
YNL058CP53947 ICL1YER065C 1674 nt5.98□□□□□ -1.45
YNL058CP53947 CLB2YPR119W 1476 nt5.98□□□□□ -1.45
YNL058CP53947 YDL218WYDL218W 954 nt5.98□□□□□ -1.45
YNL058CP53947 tR(ACG)DtR(ACG)D 73 nt5.98□□□□□ -1.45
YNL058CP53947 tR(ACG)EtR(ACG)E 73 nt5.98□□□□□ -1.45
YNL058CP53947 tR(ACG)KtR(ACG)K 73 nt5.98□□□□□ -1.45
YNL058CP53947 tR(ACG)LtR(ACG)L 73 nt5.98□□□□□ -1.45
YNL058CP53947 tR(ACG)OtR(ACG)O 73 nt5.98□□□□□ -1.45
YNL058CP53947 DRE2YKR071C 1047 nt5.98□□□□□ -1.45
YNL058CP53947 RPL10YLR075W 666 nt5.98□□□□□ -1.45
YNL058CP53947 CIN4YMR138W 576 nt5.98□□□□□ -1.45
YNL058CP53947 FSF1YOR271C 984 nt5.98□□□□□ -1.45
YNL058CP53947 PTK2YJR059W 2457 nt5.98□□□□□ -1.45
YNL058CP53947 RRP1YDR087C 837 nt5.97□□□□□ -1.45
YNL058CP53947 MSP1YGR028W 1089 nt5.97□□□□□ -1.45
YNL058CP53947 BUD14YAR014C 2130 nt5.97□□□□□ -1.45
YNL058CP53947 RSA3YLR221C 663 nt5.97□□□□□ -1.45
YNL058CP53947 TAF11YML015C 1041 nt5.97□□□□□ -1.45
YNL058CP53947 AMA1YGR225W 1782 nt5.97□□□□□ -1.45
YNL058CP53947 OXP1YKL215C 3861 nt5.97□□□□□ -1.45
YNL058CP53947 UBX2YML013W 1755 nt5.96□□□□□ -1.46
YNL058CP53947 CDC10YCR002C 969 nt5.96□□□□□ -1.46
YNL058CP53947 YHP1YDR451C 1062 nt5.96□□□□□ -1.46
YNL058CP53947 RPL7AYGL076C 735 nt5.96□□□□□ -1.46
YNL058CP53947 PHB1YGR132C 864 nt5.96□□□□□ -1.46
YNL058CP53947 DJP1YIR004W 1299 nt5.96□□□□□ -1.46
YNL058CP53947 TAF4YMR005W 1167 nt5.96□□□□□ -1.46
YNL058CP53947 RPL7BYPL198W 735 nt5.96□□□□□ -1.46
YNL058CP53947 NHP6BYBR089C-A 300 nt5.96□□□□□ -1.46
YNL058CP53947 HSP78YDR258C 2436 nt5.96□□□□□ -1.46
YNL058CP53947 KCH1YJR054W 1494 nt5.96□□□□□ -1.46
YNL058CP53947 ROG3YFR022W 2202 nt5.95□□□□□ -1.46
YNL058CP53947 MCM6YGL201C 3054 nt5.95□□□□□ -1.46
YNL058CP53947 HAP2YGL237C 798 nt5.95□□□□□ -1.46
YNL058CP53947 ARN2YHL047C 1863 nt5.95□□□□□ -1.46
YNL058CP53947 YHR140WYHR140W 720 nt5.95□□□□□ -1.46
YNL058CP53947 SRY1YKL218C 981 nt5.95□□□□□ -1.46
YNL058CP53947 PRE2YPR103W 864 nt5.95□□□□□ -1.46
YNL058CP53947 PYC2YBR218C 3543 nt5.95□□□□□ -1.46
YNL058CP53947 PDR18YNR070W 4002 nt5.95□□□□□ -1.46
YNL058CP53947 DSF1YEL070W 1509 nt5.94□□□□□ -1.46
YNL058CP53947 YNR073CYNR073C 1509 nt5.94□□□□□ -1.46
YNL058CP53947 COR1YBL045C 1374 nt5.94□□□□□ -1.46
YNL058CP53947 DFG5YMR238W 1377 nt5.94□□□□□ -1.46
YNL058CP53947 AFT1YGL071W 2073 nt5.94□□□□□ -1.46
YNL058CP53947 YER148W-AYER148W-A 579 nt5.94□□□□□ -1.46
YNL058CP53947 ACS2YLR153C 2052 nt5.94□□□□□ -1.46
YNL058CP53947 YIR007WYIR007W 2295 nt5.94□□□□□ -1.46
YNL058CP53947 TUP1YCR084C 2142 nt5.93□□□□□ -1.46
YNL058CP53947 RPN11YFR004W 921 nt5.93□□□□□ -1.46
YNL058CP53947 snR32snR32 188 nt5.93□□□□□ -1.46
YNL058CP53947 PWP1YLR196W 1731 nt5.93□□□□□ -1.46
YNL058CP53947 YMD8YML038C 1329 nt5.93□□□□□ -1.46
YNL058CP53947 RAD24YER173W 1980 nt5.93□□□□□ -1.46
YNL058CP53947 GAS3YMR215W 1575 nt5.93□□□□□ -1.46
YNL058CP53947 RSM23YGL129C 1353 nt5.93□□□□□ -1.46
YNL058CP53947 RAD3YER171W 2337 nt5.92□□□□□ -1.46
YNL058CP53947 ERP5YHR110W 639 nt5.92□□□□□ -1.46
YNL058CP53947 YLH47YPR125W 1365 nt5.92□□□□□ -1.46
YNL058CP53947 VPS70YJR126C 2436 nt5.91□□□□□ -1.46
YNL058CP53947 TAX4YJL083W 1815 nt5.91□□□□□ -1.46
YNL058CP53947 PMP3YDR276C 168 nt5.91□□□□□ -1.46
YNL058CP53947 RPS2YGL123W 765 nt5.91□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 61 ms