Protein–RNA interactions for Protein: P53747

YNR061C, Uncharacterized vacuolar membrane protein YNR061C, yeastyeast

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YNR061CP53747 RSA4YCR072C 1548 nt5.85□□□□□ -1.47
YNR061CP53747 GPI18YBR004C 1302 nt5.85□□□□□ -1.47
YNR061CP53747 RQC1YDR333C 2172 nt5.85□□□□□ -1.47
YNR061CP53747 YCR047W-AYCR047W-A 207 nt5.85□□□□□ -1.47
YNR061CP53747 KNH1YDL049C 807 nt5.85□□□□□ -1.47
YNR061CP53747 PAN6YIL145C 930 nt5.85□□□□□ -1.47
YNR061CP53747 ERG3YLR056W 1098 nt5.85□□□□□ -1.47
YNR061CP53747 YLR194CYLR194C 765 nt5.85□□□□□ -1.47
YNR061CP53747 YOL079WYOL079W 399 nt5.85□□□□□ -1.47
YNR061CP53747 MED4YOR174W 855 nt5.85□□□□□ -1.47
YNR061CP53747 AAP1YHR047C 2571 nt5.85□□□□□ -1.47
YNR061CP53747 SEC23YPR181C 2307 nt5.85□□□□□ -1.47
YNR061CP53747 MMS21YEL019C 804 nt5.84□□□□□ -1.47
YNR061CP53747 YJL171CYJL171C 1191 nt5.84□□□□□ -1.47
YNR061CP53747 SSO1YPL232W 873 nt5.84□□□□□ -1.47
YNR061CP53747 MRPL36YBR122C 534 nt5.84□□□□□ -1.47
YNR061CP53747 YBR144CYBR144C 315 nt5.84□□□□□ -1.47
YNR061CP53747 TEL2YGR099W 2067 nt5.84□□□□□ -1.47
YNR061CP53747 ECM38YLR299W 1983 nt5.84□□□□□ -1.48
YNR061CP53747 NOP2YNL061W 1857 nt5.83□□□□□ -1.48
YNR061CP53747 FAT3YKL187C 2253 nt5.83□□□□□ -1.48
YNR061CP53747 EFM1YHL039W 1758 nt5.83□□□□□ -1.48
YNR061CP53747 YML133CYML133C 4125 nt5.83□□□□□ -1.48
YNR061CP53747 EIS1YMR031C 2532 nt5.83□□□□□ -1.48
YNR061CP53747 HRQ1YDR291W 3234 nt5.83□□□□□ -1.48
YNR061CP53747 SUF5tG(CCC)O 72 nt5.83□□□□□ -1.48
YNR061CP53747 MRPL24YMR193W 777 nt5.83□□□□□ -1.48
YNR061CP53747 YCL041CYCL041C 495 nt5.83□□□□□ -1.48
YNR061CP53747 YEF1YEL041W 1488 nt5.83□□□□□ -1.48
YNR061CP53747 ICE2YIL090W 1476 nt5.83□□□□□ -1.48
YNR061CP53747 URA7YBL039C 1740 nt5.82□□□□□ -1.48
YNR061CP53747 NUP1YOR098C 3231 nt5.82□□□□□ -1.48
YNR061CP53747 RSM23YGL129C 1353 nt5.82□□□□□ -1.48
YNR061CP53747 UPS3YDR185C 540 nt5.82□□□□□ -1.48
YNR061CP53747 MPM1YJL066C 759 nt5.82□□□□□ -1.48
YNR061CP53747 PRM10YJL108C 1152 nt5.82□□□□□ -1.48
YNR061CP53747 NTG1YAL015C 1200 nt5.82□□□□□ -1.48
YNR061CP53747 YBL081WYBL081W 1107 nt5.82□□□□□ -1.48
YNR061CP53747 GAT1YFL021W 1533 nt5.82□□□□□ -1.48
YNR061CP53747 PPR1YLR014C 2715 nt5.82□□□□□ -1.48
YNR061CP53747 YTP1YNL237W 1380 nt5.81□□□□□ -1.48
YNR061CP53747 RPN5YDL147W 1338 nt5.81□□□□□ -1.48
YNR061CP53747 YJR115WYJR115W 510 nt5.81□□□□□ -1.48
YNR061CP53747 APN1YKL114C 1104 nt5.81□□□□□ -1.48
YNR061CP53747 MTQ1YNL063W 945 nt5.81□□□□□ -1.48
YNR061CP53747 SKI2YLR398C 3864 nt5.81□□□□□ -1.48
YNR061CP53747 VNX1YNL321W 2727 nt5.8□□□□□ -1.48
YNR061CP53747 YHR070C-AYHR070C-A 411 nt5.8□□□□□ -1.48
YNR061CP53747 YIR043CYIR043C 693 nt5.8□□□□□ -1.48
YNR061CP53747 RRN10YBL025W 438 nt5.8□□□□□ -1.48
YNR061CP53747 GLN1YPR035W 1113 nt5.8□□□□□ -1.48
YNR061CP53747 YBR124WYBR124W 360 nt5.8□□□□□ -1.48
YNR061CP53747 MET7YOR241W 1647 nt5.8□□□□□ -1.48
YNR061CP53747 UTR2YEL040W 1404 nt5.8□□□□□ -1.48
YNR061CP53747 NSI1YDR026C 1713 nt5.79□□□□□ -1.48
YNR061CP53747 FHL1YPR104C 2811 nt5.79□□□□□ -1.48
YNR061CP53747 RRP45YDR280W 918 nt5.79□□□□□ -1.48
YNR061CP53747 YEA6YEL006W 1008 nt5.79□□□□□ -1.48
YNR061CP53747 PHB1YGR132C 864 nt5.79□□□□□ -1.48
YNR061CP53747 tR(ACG)DtR(ACG)D 73 nt5.79□□□□□ -1.48
YNR061CP53747 tR(ACG)EtR(ACG)E 73 nt5.79□□□□□ -1.48
YNR061CP53747 tR(ACG)KtR(ACG)K 73 nt5.79□□□□□ -1.48
YNR061CP53747 tR(ACG)LtR(ACG)L 73 nt5.79□□□□□ -1.48
YNR061CP53747 tR(ACG)OtR(ACG)O 73 nt5.79□□□□□ -1.48
YNR061CP53747 RRT7YLL030C 342 nt5.79□□□□□ -1.48
YNR061CP53747 SCP1YOR367W 603 nt5.79□□□□□ -1.48
YNR061CP53747 RPS9AYPL081W 594 nt5.79□□□□□ -1.48
YNR061CP53747 GPB2YAL056W 2643 nt5.79□□□□□ -1.48
YNR061CP53747 SAC6YDR129C 1929 nt5.79□□□□□ -1.48
YNR061CP53747 YPL245WYPL245W 1365 nt5.79□□□□□ -1.48
YNR061CP53747 RSP5YER125W 2430 nt5.78□□□□□ -1.48
YNR061CP53747 ATG4YNL223W 1485 nt5.78□□□□□ -1.48
YNR061CP53747 EFT2YDR385W 2529 nt5.78□□□□□ -1.48
YNR061CP53747 EFT1YOR133W 2529 nt5.78□□□□□ -1.48
YNR061CP53747 GIR2YDR152W 798 nt5.78□□□□□ -1.48
YNR061CP53747 YDR154CYDR154C 351 nt5.78□□□□□ -1.48
YNR061CP53747 RRP4YHR069C 1080 nt5.78□□□□□ -1.48
YNR061CP53747 BCY1YIL033C 1251 nt5.78□□□□□ -1.48
YNR061CP53747 YIL055CYIL055C 1884 nt5.78□□□□□ -1.48
YNR061CP53747 KRE9YJL174W 831 nt5.78□□□□□ -1.48
YNR061CP53747 MRPL13YKR006C 795 nt5.78□□□□□ -1.48
YNR061CP53747 YNR042WYNR042W 429 nt5.78□□□□□ -1.48
YNR061CP53747 HEM15YOR176W 1182 nt5.78□□□□□ -1.48
YNR061CP53747 CCZ1YBR131W 2115 nt5.78□□□□□ -1.48
YNR061CP53747 YCL065WYCL065W 369 nt5.77□□□□□ -1.49
YNR061CP53747 YCR006CYCR006C 474 nt5.77□□□□□ -1.49
YNR061CP53747 YRA1YDR381W 681 nt5.77□□□□□ -1.49
YNR061CP53747 YJL107CYJL107C 1164 nt5.77□□□□□ -1.49
YNR061CP53747 YPL062WYPL062W 405 nt5.77□□□□□ -1.49
YNR061CP53747 MRP51YPL118W 1035 nt5.77□□□□□ -1.49
YNR061CP53747 TIP41YPR040W 1071 nt5.77□□□□□ -1.49
YNR061CP53747 RPL21AYBR191W 483 nt5.77□□□□□ -1.49
YNR061CP53747 VRP1YLR337C 2454 nt5.77□□□□□ -1.49
YNR061CP53747 TAH18YPR048W 1872 nt5.77□□□□□ -1.49
YNR061CP53747 RTT103YDR289C 1230 nt5.76□□□□□ -1.49
YNR061CP53747 YMR119W-AYMR119W-A 375 nt5.76□□□□□ -1.49
YNR061CP53747 ALG5YPL227C 1005 nt5.76□□□□□ -1.49
YNR061CP53747 CRP1YHR146W 1398 nt5.76□□□□□ -1.49
YNR061CP53747 GUD1YDL238C 1470 nt5.76□□□□□ -1.49
YNR061CP53747 HMLALPHA1YCL066W 528 nt5.75□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.4 ms