Protein–RNA interactions for Protein: P13727

PRG2, Bone marrow proteoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG2P13727 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRG2P13727 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRG2P13727 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRG2P13727 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRG2P13727 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRG2P13727 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRG2P13727 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRG2P13727 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRG2P13727 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRG2P13727 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRG2P13727 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRG2P13727 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRG2P13727 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRG2P13727 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRG2P13727 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRG2P13727 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRG2P13727 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRG2P13727 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PRG2P13727 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRG2P13727 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRG2P13727 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRG2P13727 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRG2P13727 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRG2P13727 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRG2P13727 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRG2P13727 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRG2P13727 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRG2P13727 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRG2P13727 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRG2P13727 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRG2P13727 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PRG2P13727 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PRG2P13727 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRG2P13727 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRG2P13727 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRG2P13727 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRG2P13727 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRG2P13727 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRG2P13727 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRG2P13727 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRG2P13727 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRG2P13727 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRG2P13727 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRG2P13727 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRG2P13727 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRG2P13727 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRG2P13727 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRG2P13727 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRG2P13727 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRG2P13727 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRG2P13727 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRG2P13727 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRG2P13727 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRG2P13727 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRG2P13727 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRG2P13727 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRG2P13727 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRG2P13727 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRG2P13727 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRG2P13727 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRG2P13727 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRG2P13727 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRG2P13727 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PRG2P13727 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRG2P13727 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRG2P13727 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRG2P13727 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PRG2P13727 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRG2P13727 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRG2P13727 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRG2P13727 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRG2P13727 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRG2P13727 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRG2P13727 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRG2P13727 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PRG2P13727 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRG2P13727 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PRG2P13727 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRG2P13727 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRG2P13727 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRG2P13727 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRG2P13727 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRG2P13727 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRG2P13727 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PRG2P13727 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRG2P13727 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRG2P13727 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRG2P13727 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRG2P13727 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRG2P13727 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRG2P13727 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRG2P13727 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRG2P13727 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRG2P13727 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRG2P13727 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRG2P13727 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRG2P13727 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRG2P13727 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRG2P13727 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRG2P13727 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms