Protein–RNA interactions for Protein: P08240

SRPRA, Signal recognition particle receptor subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRAP08240 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRPRAP08240 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRPRAP08240 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SRPRAP08240 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRPRAP08240 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRPRAP08240 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
SRPRAP08240 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SRPRAP08240 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SRPRAP08240 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SRPRAP08240 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SRPRAP08240 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SRPRAP08240 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SRPRAP08240 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SRPRAP08240 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SRPRAP08240 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SRPRAP08240 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SRPRAP08240 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SRPRAP08240 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SRPRAP08240 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SRPRAP08240 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SRPRAP08240 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SRPRAP08240 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SRPRAP08240 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SRPRAP08240 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SRPRAP08240 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SRPRAP08240 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SRPRAP08240 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SRPRAP08240 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SRPRAP08240 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SRPRAP08240 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SRPRAP08240 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SRPRAP08240 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SRPRAP08240 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SRPRAP08240 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRPRAP08240 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRPRAP08240 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SRPRAP08240 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SRPRAP08240 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SRPRAP08240 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SRPRAP08240 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SRPRAP08240 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SRPRAP08240 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SRPRAP08240 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SRPRAP08240 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRPRAP08240 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRPRAP08240 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRPRAP08240 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRPRAP08240 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRPRAP08240 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRPRAP08240 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRPRAP08240 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRPRAP08240 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRPRAP08240 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRPRAP08240 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRPRAP08240 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRPRAP08240 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRPRAP08240 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRPRAP08240 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRPRAP08240 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRPRAP08240 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRPRAP08240 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRPRAP08240 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRPRAP08240 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRPRAP08240 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRPRAP08240 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRPRAP08240 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRPRAP08240 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRPRAP08240 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRPRAP08240 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRPRAP08240 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRPRAP08240 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRPRAP08240 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRPRAP08240 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRPRAP08240 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRPRAP08240 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRPRAP08240 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SRPRAP08240 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRPRAP08240 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRPRAP08240 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRPRAP08240 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRPRAP08240 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRPRAP08240 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRPRAP08240 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRPRAP08240 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRPRAP08240 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRPRAP08240 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRPRAP08240 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRPRAP08240 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SRPRAP08240 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRPRAP08240 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRPRAP08240 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRPRAP08240 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SRPRAP08240 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SRPRAP08240 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SRPRAP08240 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SRPRAP08240 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SRPRAP08240 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SRPRAP08240 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SRPRAP08240 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SRPRAP08240 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms