Protein–RNA interactions for Protein: O43765

SGTA, Small glutamine-rich tetratricopeptide repeat-containing protein alpha, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGTAO43765 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SGTAO43765 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SGTAO43765 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SGTAO43765 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SGTAO43765 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SGTAO43765 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SGTAO43765 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SGTAO43765 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SGTAO43765 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
SGTAO43765 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SGTAO43765 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SGTAO43765 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SGTAO43765 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SGTAO43765 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SGTAO43765 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SGTAO43765 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SGTAO43765 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SGTAO43765 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SGTAO43765 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SGTAO43765 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SGTAO43765 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SGTAO43765 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SGTAO43765 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SGTAO43765 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SGTAO43765 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SGTAO43765 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SGTAO43765 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SGTAO43765 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SGTAO43765 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SGTAO43765 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SGTAO43765 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SGTAO43765 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SGTAO43765 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SGTAO43765 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SGTAO43765 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SGTAO43765 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SGTAO43765 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SGTAO43765 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SGTAO43765 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SGTAO43765 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SGTAO43765 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SGTAO43765 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SGTAO43765 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SGTAO43765 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SGTAO43765 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SGTAO43765 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SGTAO43765 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SGTAO43765 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SGTAO43765 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SGTAO43765 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SGTAO43765 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SGTAO43765 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SGTAO43765 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SGTAO43765 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SGTAO43765 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SGTAO43765 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SGTAO43765 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SGTAO43765 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SGTAO43765 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SGTAO43765 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SGTAO43765 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SGTAO43765 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SGTAO43765 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SGTAO43765 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SGTAO43765 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SGTAO43765 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SGTAO43765 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SGTAO43765 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SGTAO43765 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SGTAO43765 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SGTAO43765 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SGTAO43765 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SGTAO43765 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SGTAO43765 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SGTAO43765 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SGTAO43765 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SGTAO43765 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SGTAO43765 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SGTAO43765 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SGTAO43765 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SGTAO43765 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SGTAO43765 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SGTAO43765 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SGTAO43765 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SGTAO43765 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SGTAO43765 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SGTAO43765 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SGTAO43765 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SGTAO43765 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SGTAO43765 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SGTAO43765 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SGTAO43765 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SGTAO43765 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SGTAO43765 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SGTAO43765 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SGTAO43765 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SGTAO43765 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SGTAO43765 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SGTAO43765 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SGTAO43765 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms