Protein–RNA interactions for Protein: O43149

ZZEF1, Zinc finger ZZ-type and EF-hand domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,961 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZZEF1O43149 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZZEF1O43149 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZZEF1O43149 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZZEF1O43149 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZZEF1O43149 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZZEF1O43149 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZZEF1O43149 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZZEF1O43149 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZZEF1O43149 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZZEF1O43149 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZZEF1O43149 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZZEF1O43149 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZZEF1O43149 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZZEF1O43149 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZZEF1O43149 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZZEF1O43149 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZZEF1O43149 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZZEF1O43149 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ZZEF1O43149 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZZEF1O43149 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZZEF1O43149 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZZEF1O43149 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ZZEF1O43149 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZZEF1O43149 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ZZEF1O43149 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZZEF1O43149 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZZEF1O43149 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZZEF1O43149 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZZEF1O43149 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZZEF1O43149 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZZEF1O43149 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZZEF1O43149 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ZZEF1O43149 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZZEF1O43149 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ZZEF1O43149 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZZEF1O43149 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZZEF1O43149 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZZEF1O43149 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZZEF1O43149 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZZEF1O43149 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZZEF1O43149 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ZZEF1O43149 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZZEF1O43149 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZZEF1O43149 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZZEF1O43149 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ZZEF1O43149 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZZEF1O43149 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZZEF1O43149 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZZEF1O43149 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZZEF1O43149 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZZEF1O43149 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZZEF1O43149 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZZEF1O43149 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZZEF1O43149 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZZEF1O43149 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZZEF1O43149 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZZEF1O43149 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ZZEF1O43149 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZZEF1O43149 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZZEF1O43149 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ZZEF1O43149 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZZEF1O43149 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZZEF1O43149 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZZEF1O43149 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZZEF1O43149 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZZEF1O43149 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZZEF1O43149 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZZEF1O43149 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZZEF1O43149 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZZEF1O43149 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZZEF1O43149 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZZEF1O43149 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
ZZEF1O43149 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZZEF1O43149 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ZZEF1O43149 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZZEF1O43149 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZZEF1O43149 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ZZEF1O43149 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZZEF1O43149 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ZZEF1O43149 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZZEF1O43149 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZZEF1O43149 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZZEF1O43149 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZZEF1O43149 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZZEF1O43149 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZZEF1O43149 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZZEF1O43149 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZZEF1O43149 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZZEF1O43149 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZZEF1O43149 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZZEF1O43149 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZZEF1O43149 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZZEF1O43149 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZZEF1O43149 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ZZEF1O43149 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZZEF1O43149 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZZEF1O43149 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ZZEF1O43149 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZZEF1O43149 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZZEF1O43149 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms