Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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FOXD3Q9UJU5 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 HCG24-202ENST00000414398 717 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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FOXD3Q9UJU5 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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FOXD3Q9UJU5 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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FOXD3Q9UJU5 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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FOXD3Q9UJU5 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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FOXD3Q9UJU5 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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