Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms