Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWF4

SLC52A1, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 1, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A1Q9NWF4 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC52A1Q9NWF4 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC52A1Q9NWF4 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC52A1Q9NWF4 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC52A1Q9NWF4 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC52A1Q9NWF4 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC52A1Q9NWF4 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC52A1Q9NWF4 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC52A1Q9NWF4 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC52A1Q9NWF4 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC52A1Q9NWF4 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC52A1Q9NWF4 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC52A1Q9NWF4 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC52A1Q9NWF4 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC52A1Q9NWF4 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC52A1Q9NWF4 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC52A1Q9NWF4 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC52A1Q9NWF4 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC52A1Q9NWF4 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC52A1Q9NWF4 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC52A1Q9NWF4 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC52A1Q9NWF4 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC52A1Q9NWF4 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC52A1Q9NWF4 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC52A1Q9NWF4 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC52A1Q9NWF4 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC52A1Q9NWF4 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC52A1Q9NWF4 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC52A1Q9NWF4 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC52A1Q9NWF4 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC52A1Q9NWF4 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC52A1Q9NWF4 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC52A1Q9NWF4 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC52A1Q9NWF4 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC52A1Q9NWF4 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC52A1Q9NWF4 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC52A1Q9NWF4 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC52A1Q9NWF4 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC52A1Q9NWF4 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC52A1Q9NWF4 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC52A1Q9NWF4 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC52A1Q9NWF4 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC52A1Q9NWF4 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC52A1Q9NWF4 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC52A1Q9NWF4 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC52A1Q9NWF4 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC52A1Q9NWF4 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC52A1Q9NWF4 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC52A1Q9NWF4 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC52A1Q9NWF4 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC52A1Q9NWF4 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC52A1Q9NWF4 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC52A1Q9NWF4 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC52A1Q9NWF4 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC52A1Q9NWF4 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC52A1Q9NWF4 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC52A1Q9NWF4 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC52A1Q9NWF4 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC52A1Q9NWF4 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC52A1Q9NWF4 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC52A1Q9NWF4 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC52A1Q9NWF4 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC52A1Q9NWF4 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC52A1Q9NWF4 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC52A1Q9NWF4 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC52A1Q9NWF4 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC52A1Q9NWF4 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC52A1Q9NWF4 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC52A1Q9NWF4 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC52A1Q9NWF4 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC52A1Q9NWF4 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC52A1Q9NWF4 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC52A1Q9NWF4 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC52A1Q9NWF4 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC52A1Q9NWF4 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC52A1Q9NWF4 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC52A1Q9NWF4 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC52A1Q9NWF4 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC52A1Q9NWF4 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC52A1Q9NWF4 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC52A1Q9NWF4 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC52A1Q9NWF4 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC52A1Q9NWF4 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC52A1Q9NWF4 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC52A1Q9NWF4 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC52A1Q9NWF4 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC52A1Q9NWF4 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC52A1Q9NWF4 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC52A1Q9NWF4 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC52A1Q9NWF4 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC52A1Q9NWF4 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC52A1Q9NWF4 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC52A1Q9NWF4 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC52A1Q9NWF4 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC52A1Q9NWF4 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC52A1Q9NWF4 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC52A1Q9NWF4 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC52A1Q9NWF4 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC52A1Q9NWF4 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC52A1Q9NWF4 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms