Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPOCK3Q9BQ16 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPOCK3Q9BQ16 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPOCK3Q9BQ16 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPOCK3Q9BQ16 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPOCK3Q9BQ16 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPOCK3Q9BQ16 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPOCK3Q9BQ16 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPOCK3Q9BQ16 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPOCK3Q9BQ16 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPOCK3Q9BQ16 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPOCK3Q9BQ16 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPOCK3Q9BQ16 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPOCK3Q9BQ16 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPOCK3Q9BQ16 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPOCK3Q9BQ16 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPOCK3Q9BQ16 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPOCK3Q9BQ16 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPOCK3Q9BQ16 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPOCK3Q9BQ16 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
SPOCK3Q9BQ16 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPOCK3Q9BQ16 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
SPOCK3Q9BQ16 LINC02536-201ENST00000625799 625 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPOCK3Q9BQ16 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPOCK3Q9BQ16 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPOCK3Q9BQ16 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPOCK3Q9BQ16 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPOCK3Q9BQ16 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPOCK3Q9BQ16 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPOCK3Q9BQ16 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPOCK3Q9BQ16 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
SPOCK3Q9BQ16 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPOCK3Q9BQ16 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPOCK3Q9BQ16 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPOCK3Q9BQ16 TMUB2-201ENST00000319511 2418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPOCK3Q9BQ16 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPOCK3Q9BQ16 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
SPOCK3Q9BQ16 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
SPOCK3Q9BQ16 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
SPOCK3Q9BQ16 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
SPOCK3Q9BQ16 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
SPOCK3Q9BQ16 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
SPOCK3Q9BQ16 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
SPOCK3Q9BQ16 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
SPOCK3Q9BQ16 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
SPOCK3Q9BQ16 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms