Protein–RNA interactions for Protein: Q99627

COPS8, COP9 signalosome complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS8Q99627 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
COPS8Q99627 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPS8Q99627 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPS8Q99627 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPS8Q99627 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPS8Q99627 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPS8Q99627 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPS8Q99627 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPS8Q99627 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPS8Q99627 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPS8Q99627 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPS8Q99627 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPS8Q99627 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPS8Q99627 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPS8Q99627 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPS8Q99627 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPS8Q99627 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPS8Q99627 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPS8Q99627 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPS8Q99627 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPS8Q99627 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
COPS8Q99627 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
COPS8Q99627 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
COPS8Q99627 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
COPS8Q99627 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
COPS8Q99627 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
COPS8Q99627 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
COPS8Q99627 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
COPS8Q99627 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPS8Q99627 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPS8Q99627 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPS8Q99627 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPS8Q99627 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPS8Q99627 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPS8Q99627 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPS8Q99627 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPS8Q99627 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPS8Q99627 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPS8Q99627 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
COPS8Q99627 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPS8Q99627 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPS8Q99627 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPS8Q99627 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
COPS8Q99627 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
COPS8Q99627 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPS8Q99627 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPS8Q99627 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPS8Q99627 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPS8Q99627 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPS8Q99627 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPS8Q99627 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPS8Q99627 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
COPS8Q99627 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPS8Q99627 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPS8Q99627 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPS8Q99627 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPS8Q99627 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPS8Q99627 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPS8Q99627 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPS8Q99627 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPS8Q99627 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPS8Q99627 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPS8Q99627 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPS8Q99627 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPS8Q99627 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPS8Q99627 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPS8Q99627 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPS8Q99627 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPS8Q99627 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPS8Q99627 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPS8Q99627 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPS8Q99627 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPS8Q99627 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPS8Q99627 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPS8Q99627 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPS8Q99627 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPS8Q99627 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPS8Q99627 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPS8Q99627 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
COPS8Q99627 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPS8Q99627 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPS8Q99627 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPS8Q99627 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPS8Q99627 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPS8Q99627 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPS8Q99627 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPS8Q99627 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPS8Q99627 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPS8Q99627 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPS8Q99627 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPS8Q99627 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPS8Q99627 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPS8Q99627 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPS8Q99627 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPS8Q99627 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPS8Q99627 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPS8Q99627 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPS8Q99627 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPS8Q99627 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPS8Q99627 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms