Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TOPBP1Q92547 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TOPBP1Q92547 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TOPBP1Q92547 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TOPBP1Q92547 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
TOPBP1Q92547 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TOPBP1Q92547 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TOPBP1Q92547 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TOPBP1Q92547 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
TOPBP1Q92547 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TOPBP1Q92547 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TOPBP1Q92547 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TOPBP1Q92547 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TOPBP1Q92547 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TOPBP1Q92547 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TOPBP1Q92547 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TOPBP1Q92547 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TOPBP1Q92547 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TOPBP1Q92547 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TOPBP1Q92547 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TOPBP1Q92547 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TOPBP1Q92547 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TOPBP1Q92547 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
TOPBP1Q92547 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TOPBP1Q92547 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TOPBP1Q92547 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TOPBP1Q92547 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TOPBP1Q92547 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TOPBP1Q92547 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TOPBP1Q92547 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TOPBP1Q92547 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TOPBP1Q92547 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TOPBP1Q92547 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TOPBP1Q92547 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TOPBP1Q92547 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
TOPBP1Q92547 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TOPBP1Q92547 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TOPBP1Q92547 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TOPBP1Q92547 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
TOPBP1Q92547 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TOPBP1Q92547 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TOPBP1Q92547 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TOPBP1Q92547 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TOPBP1Q92547 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TOPBP1Q92547 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TOPBP1Q92547 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TOPBP1Q92547 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TOPBP1Q92547 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TOPBP1Q92547 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TOPBP1Q92547 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TOPBP1Q92547 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TOPBP1Q92547 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TOPBP1Q92547 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TOPBP1Q92547 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TOPBP1Q92547 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TOPBP1Q92547 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TOPBP1Q92547 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
TOPBP1Q92547 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TOPBP1Q92547 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TOPBP1Q92547 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TOPBP1Q92547 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TOPBP1Q92547 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TOPBP1Q92547 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TOPBP1Q92547 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TOPBP1Q92547 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TOPBP1Q92547 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TOPBP1Q92547 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TOPBP1Q92547 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TOPBP1Q92547 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
TOPBP1Q92547 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TOPBP1Q92547 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TOPBP1Q92547 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TOPBP1Q92547 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TOPBP1Q92547 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TOPBP1Q92547 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TOPBP1Q92547 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TOPBP1Q92547 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
TOPBP1Q92547 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
TOPBP1Q92547 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
TOPBP1Q92547 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TOPBP1Q92547 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TOPBP1Q92547 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TOPBP1Q92547 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TOPBP1Q92547 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TOPBP1Q92547 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TOPBP1Q92547 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TOPBP1Q92547 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TOPBP1Q92547 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TOPBP1Q92547 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TOPBP1Q92547 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TOPBP1Q92547 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TOPBP1Q92547 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TOPBP1Q92547 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TOPBP1Q92547 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TOPBP1Q92547 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TOPBP1Q92547 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
TOPBP1Q92547 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TOPBP1Q92547 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TOPBP1Q92547 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TOPBP1Q92547 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms