Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC3

PYDC1, Pyrin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYDC1Q8WXC3 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PYDC1Q8WXC3 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PYDC1Q8WXC3 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PYDC1Q8WXC3 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PYDC1Q8WXC3 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PYDC1Q8WXC3 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PYDC1Q8WXC3 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PYDC1Q8WXC3 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PYDC1Q8WXC3 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PYDC1Q8WXC3 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PYDC1Q8WXC3 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PYDC1Q8WXC3 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PYDC1Q8WXC3 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PYDC1Q8WXC3 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PYDC1Q8WXC3 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PYDC1Q8WXC3 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PYDC1Q8WXC3 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PYDC1Q8WXC3 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PYDC1Q8WXC3 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PYDC1Q8WXC3 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PYDC1Q8WXC3 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PYDC1Q8WXC3 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PYDC1Q8WXC3 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PYDC1Q8WXC3 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PYDC1Q8WXC3 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PYDC1Q8WXC3 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PYDC1Q8WXC3 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PYDC1Q8WXC3 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PYDC1Q8WXC3 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PYDC1Q8WXC3 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PYDC1Q8WXC3 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PYDC1Q8WXC3 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PYDC1Q8WXC3 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PYDC1Q8WXC3 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PYDC1Q8WXC3 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PYDC1Q8WXC3 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PYDC1Q8WXC3 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PYDC1Q8WXC3 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PYDC1Q8WXC3 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PYDC1Q8WXC3 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PYDC1Q8WXC3 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PYDC1Q8WXC3 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PYDC1Q8WXC3 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PYDC1Q8WXC3 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PYDC1Q8WXC3 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PYDC1Q8WXC3 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PYDC1Q8WXC3 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PYDC1Q8WXC3 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PYDC1Q8WXC3 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PYDC1Q8WXC3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PYDC1Q8WXC3 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PYDC1Q8WXC3 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PYDC1Q8WXC3 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PYDC1Q8WXC3 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PYDC1Q8WXC3 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PYDC1Q8WXC3 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PYDC1Q8WXC3 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PYDC1Q8WXC3 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PYDC1Q8WXC3 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PYDC1Q8WXC3 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PYDC1Q8WXC3 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PYDC1Q8WXC3 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PYDC1Q8WXC3 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PYDC1Q8WXC3 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PYDC1Q8WXC3 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PYDC1Q8WXC3 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PYDC1Q8WXC3 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PYDC1Q8WXC3 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PYDC1Q8WXC3 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PYDC1Q8WXC3 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PYDC1Q8WXC3 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PYDC1Q8WXC3 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PYDC1Q8WXC3 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PYDC1Q8WXC3 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PYDC1Q8WXC3 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PYDC1Q8WXC3 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PYDC1Q8WXC3 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PYDC1Q8WXC3 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PYDC1Q8WXC3 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PYDC1Q8WXC3 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PYDC1Q8WXC3 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PYDC1Q8WXC3 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PYDC1Q8WXC3 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PYDC1Q8WXC3 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PYDC1Q8WXC3 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PYDC1Q8WXC3 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PYDC1Q8WXC3 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PYDC1Q8WXC3 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PYDC1Q8WXC3 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PYDC1Q8WXC3 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PYDC1Q8WXC3 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PYDC1Q8WXC3 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PYDC1Q8WXC3 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PYDC1Q8WXC3 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PYDC1Q8WXC3 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PYDC1Q8WXC3 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PYDC1Q8WXC3 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PYDC1Q8WXC3 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PYDC1Q8WXC3 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PYDC1Q8WXC3 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms