Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF64

GIPC3, PDZ domain-containing protein GIPC3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3Q8TF64 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GIPC3Q8TF64 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms