Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W8

FAM71D, Protein FAM71D, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71DQ8N9W8 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM71DQ8N9W8 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM71DQ8N9W8 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM71DQ8N9W8 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM71DQ8N9W8 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM71DQ8N9W8 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM71DQ8N9W8 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM71DQ8N9W8 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM71DQ8N9W8 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM71DQ8N9W8 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM71DQ8N9W8 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM71DQ8N9W8 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM71DQ8N9W8 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM71DQ8N9W8 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM71DQ8N9W8 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM71DQ8N9W8 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM71DQ8N9W8 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM71DQ8N9W8 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM71DQ8N9W8 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM71DQ8N9W8 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM71DQ8N9W8 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM71DQ8N9W8 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM71DQ8N9W8 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM71DQ8N9W8 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM71DQ8N9W8 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM71DQ8N9W8 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM71DQ8N9W8 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM71DQ8N9W8 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM71DQ8N9W8 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM71DQ8N9W8 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM71DQ8N9W8 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM71DQ8N9W8 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM71DQ8N9W8 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM71DQ8N9W8 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM71DQ8N9W8 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM71DQ8N9W8 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM71DQ8N9W8 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM71DQ8N9W8 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM71DQ8N9W8 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM71DQ8N9W8 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM71DQ8N9W8 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM71DQ8N9W8 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM71DQ8N9W8 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM71DQ8N9W8 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM71DQ8N9W8 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM71DQ8N9W8 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM71DQ8N9W8 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM71DQ8N9W8 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM71DQ8N9W8 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM71DQ8N9W8 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM71DQ8N9W8 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
FAM71DQ8N9W8 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM71DQ8N9W8 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM71DQ8N9W8 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM71DQ8N9W8 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM71DQ8N9W8 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM71DQ8N9W8 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM71DQ8N9W8 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM71DQ8N9W8 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM71DQ8N9W8 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM71DQ8N9W8 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM71DQ8N9W8 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM71DQ8N9W8 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM71DQ8N9W8 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM71DQ8N9W8 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM71DQ8N9W8 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM71DQ8N9W8 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM71DQ8N9W8 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM71DQ8N9W8 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM71DQ8N9W8 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM71DQ8N9W8 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM71DQ8N9W8 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM71DQ8N9W8 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM71DQ8N9W8 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM71DQ8N9W8 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM71DQ8N9W8 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM71DQ8N9W8 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM71DQ8N9W8 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM71DQ8N9W8 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM71DQ8N9W8 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM71DQ8N9W8 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM71DQ8N9W8 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM71DQ8N9W8 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM71DQ8N9W8 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM71DQ8N9W8 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM71DQ8N9W8 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM71DQ8N9W8 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM71DQ8N9W8 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM71DQ8N9W8 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM71DQ8N9W8 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM71DQ8N9W8 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM71DQ8N9W8 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM71DQ8N9W8 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM71DQ8N9W8 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM71DQ8N9W8 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM71DQ8N9W8 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM71DQ8N9W8 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM71DQ8N9W8 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM71DQ8N9W8 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM71DQ8N9W8 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms