Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3A8

PARP8, Poly [ADP-ribose] polymerase 8, humanhuman

Predictions only

Length 854 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP8Q8N3A8 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PARP8Q8N3A8 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms