Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1M1

BEST3, Bestrophin-3, humanhuman

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST3Q8N1M1 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BEST3Q8N1M1 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BEST3Q8N1M1 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BEST3Q8N1M1 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BEST3Q8N1M1 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BEST3Q8N1M1 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BEST3Q8N1M1 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BEST3Q8N1M1 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BEST3Q8N1M1 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BEST3Q8N1M1 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BEST3Q8N1M1 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BEST3Q8N1M1 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BEST3Q8N1M1 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BEST3Q8N1M1 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BEST3Q8N1M1 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
BEST3Q8N1M1 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BEST3Q8N1M1 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BEST3Q8N1M1 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
BEST3Q8N1M1 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BEST3Q8N1M1 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
BEST3Q8N1M1 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
BEST3Q8N1M1 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BEST3Q8N1M1 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BEST3Q8N1M1 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BEST3Q8N1M1 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BEST3Q8N1M1 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BEST3Q8N1M1 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BEST3Q8N1M1 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BEST3Q8N1M1 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BEST3Q8N1M1 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BEST3Q8N1M1 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BEST3Q8N1M1 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BEST3Q8N1M1 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BEST3Q8N1M1 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BEST3Q8N1M1 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BEST3Q8N1M1 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
BEST3Q8N1M1 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BEST3Q8N1M1 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
BEST3Q8N1M1 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
BEST3Q8N1M1 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
BEST3Q8N1M1 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
BEST3Q8N1M1 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BEST3Q8N1M1 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BEST3Q8N1M1 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BEST3Q8N1M1 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BEST3Q8N1M1 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BEST3Q8N1M1 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BEST3Q8N1M1 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BEST3Q8N1M1 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BEST3Q8N1M1 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BEST3Q8N1M1 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BEST3Q8N1M1 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BEST3Q8N1M1 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BEST3Q8N1M1 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BEST3Q8N1M1 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BEST3Q8N1M1 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
BEST3Q8N1M1 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.08■□□□□ 0
BEST3Q8N1M1 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BEST3Q8N1M1 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.08■□□□□ 0
BEST3Q8N1M1 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BEST3Q8N1M1 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BEST3Q8N1M1 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BEST3Q8N1M1 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BEST3Q8N1M1 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
BEST3Q8N1M1 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BEST3Q8N1M1 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.08■□□□□ 0
BEST3Q8N1M1 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BEST3Q8N1M1 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BEST3Q8N1M1 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BEST3Q8N1M1 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BEST3Q8N1M1 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BEST3Q8N1M1 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BEST3Q8N1M1 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BEST3Q8N1M1 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BEST3Q8N1M1 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.08■□□□□ 0
BEST3Q8N1M1 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BEST3Q8N1M1 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BEST3Q8N1M1 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
BEST3Q8N1M1 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BEST3Q8N1M1 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BEST3Q8N1M1 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.08■□□□□ 0
BEST3Q8N1M1 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BEST3Q8N1M1 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BEST3Q8N1M1 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BEST3Q8N1M1 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BEST3Q8N1M1 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BEST3Q8N1M1 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BEST3Q8N1M1 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BEST3Q8N1M1 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BEST3Q8N1M1 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BEST3Q8N1M1 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BEST3Q8N1M1 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BEST3Q8N1M1 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BEST3Q8N1M1 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BEST3Q8N1M1 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BEST3Q8N1M1 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BEST3Q8N1M1 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BEST3Q8N1M1 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
BEST3Q8N1M1 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BEST3Q8N1M1 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms