Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms